虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究
2023年04月10日
来源:中国比较医学杂志2023年第3期
作者:渠凤甜 周海健 薛佳琦 杜小莉 胡锦瑞 崔志刚 谢桂林 刘辰庚 孟双
责任编辑:lascn
摘要:为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。
目的 为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。
方法 对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型:利用B-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性:通过药罐实验及耐药基因检测分析其耐药特征:利用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序列进行分析。
结果 菌株18FX22鉴定为达卡气单胞菌。该菌的致病性主要表现:有一溶血能力和胞外蛋白酶活性:对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性。经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发现其对阿莫西林/克拉维酸,头孢座林和多粘菌素3种药物有耐药性。全基因组测序结果 发现:18FX22的全基因组大小为4811079bp,GC含量为61.33%。C0G注释发现18FX22共有3850个基因,具有20类功能。前噬菌体预测结果 发现18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列。全球达卡气单胞菌的聚类结果 显示该菌与GCA016729585的进化关系更近。
结论 本研究从商品虾分离出达卡气单胞菌,发现该菌株的毒性较强,指示应加强海鲜食品安全的管控,并为达卡气单胞菌的防治提供参考。
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