目的 鉴定 26S 蛋白酶体非 ATP 酶调节亚基 13(PSMD13)在Ⅱ型糖尿病中国地鼠的表达及对其理 化性质、信号肽、亚细胞定位、功能结构域等进行分析,为深入研究其功能提供理论依据。

方法 荧光定量 PCR 法 检测 PSMD13 mRNA 在中国地鼠和糖尿病地鼠肝、骨骼肌、脂肪和小肠组织的表达;PSMD13 氨基酸序列从 NCBI 网 站下载,氨基酸同源性分析采用 DNAman 软件;PSMD13 蛋白的理化性质分析采用 Prot Param 在线工具;PSMD13 蛋 白的亲疏水性、信号肽、亚细胞定位采用 Prot Scale 软件分析;PSMD13 蛋白结构域、二级结构分别采用 Conserved Domain 数据库和 SOPMA 工具分析;PSMD13 蛋白质的互作蛋白及功能网络采用 STRING 数据库分析。

结果 RTqPCR 结果显示 PSMD13 mRNA 在糖尿病地鼠脂肪组织中表达下降;PSMD13 位于中国地鼠第 3 号染色体,含有 13 个外显子,相对分子质量为 42 942. 48,含有 378 个氨基酸残基;PSMD13 理论等电点为 6. 1,属酸性蛋白;其与小鼠、 大鼠、果蝇、猩猩和人 PSMD13 的氨基酸序列同源性高达 97. 78%;PSMD13 蛋白质无信号肽、无跨膜结构,主要位于 细胞质中;PSMD13 蛋白质羧基端含有一个 PCI 结构域,与 PSMD7、PSMD8、PSMA3、PSMC1 和 USP14 等相互作用, 参与泛素依赖性蛋白质分解代谢过程。

结论 PSMD13 在糖尿病中国地鼠脂肪组织中表达下降,该蛋白质在进化 上高度保守,参与蛋白质的蛋白酶体降解途径,其表达下调可能参与糖尿病的发生发展。

阅读原文：中国地鼠26S蛋白酶体非ATP酶调节亚基13的表达鉴定及生物信息学分析.pdf