基于网络药理学研究肾衰方治疗CKD心肌损伤的作用机制
目的 采用网络药理学和分子对接的研究方法,预测肾衰方慢性肾病( chronic kidney disease,CKD) 心肌损伤的作用机制。
方法 利用 TCMSP 数据库、Herb 本草组鉴数据库( http: / / herb. ac. cn / ) 和 SWISS Target prediction 数据库筛选活性成分靶点信息,然后通过 Uniprot 数据库筛选出人类靶点和规范基因名;使用 Cytoscape 3. 7. 2 软件作药物-有效成分-靶点网络图;选用 GeneCards 数据库收集疾病相关靶点;利用 Venny 2. 1 建立“肾衰 方”抗 CKD 心肌损伤的基因靶点数据库;利用 String 数据库构建主要成分靶点互作网络并筛选关键靶点;然后导入 Cytoscape 3. 7. 2 软件进行拓扑分析和构建 PPI 网络图,最后用 DAVID 平台进行 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)通路富集分析(P<0. 05)和 Gene Ontology(GO)生物学功能注释。
结果 经过筛选,肾衰方活性 化合物为 252 个;肾衰方与 CKD 心肌损伤共同靶点 649 个,其中 AKT1、TNF、MAPK3、VEGFA 可能是肾衰方治疗 CKD 心肌损伤的重要靶点;进行 GO 分析,得到 Biological precess(BP) 1485 条目,Celler component(CC) 176 条目, Molecular function(MF)386 条目,其中富集基因数量最多的条目为 plasma membrane、cytosol、cytoplasm,分别分布了 313、304、276 个基因;进行 KEGG 分析,肾衰方治疗 CKD 心肌损伤参与的通路可能有 HIF-1α 通路、Lipid and atherosclerosis 通路、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications 通路、PI3K-AKT 通路、Insulin resistance 通 路等。
结论 肾衰方可能通过参与改善胰岛素抵抗,改善脂质代谢、抗动脉粥样硬化,调节炎性因子和血管内皮生 长因子等的表达等多重机制发挥心肾保护作用,其中 PI3K/ AKT 和 MAPK 可能是重要的调节通路。
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