中国水产科研院在拟穴青蟹转录组资源挖掘与利用获进展
2014年08月20日
来源：中国科学报
作者：中国科学报
责任编辑：admin
摘要：中国水产科学研究院东海水产研究所在拟穴青蟹转录组高通量454测序、组装与注释、信号通路分析、分子标记挖掘及与生长性状相关的标记筛选研究中取得一系列新进展，研究成果相继发表在《公共科学图书馆—综合》《分子生物学报告》等期刊上。
拟穴青蟹属大型海水蟹类，是我国重要的海水养殖和捕捞对象。日前，科研人员利用454二代测序技术对拟穴青蟹转录组进行了深度测序，现已获得540 Mbp的数据量、131万条高质量reads;同时，还鉴定出1.9万多个微卫星序列和3.6万多个snp位点。
项目组针对转录组来源的信息进行深入挖掘和应用，共开发出164个多态性微卫星标记，验证了91个SNP位点，获得了线粒体全基因组序列，其中3个微卫星标记与12个表型生长性状之间具有显著的相关性，初步确定了Scpa36位点的BC基因型、Scpa75位点的BC和BD基因型及Spm30位点的AC基因型，在拟穴青蟹选择育种中具有最大的辅助育种潜力。
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