对于普通的转基因，表达的区域将取决于启动子。如果选择全身表达的启动子，如Rosa26, CAG等，将得到全身表达的转基因小鼠；如果选择一些组织特异性表达的基因的启动子，将得到组织特异性表达的转基因小鼠，如在AP2的promoter启 动下进行表达，会得到脂肪组织特异表达的转基因小鼠。

需要特别说明的是，这种转基因的策略是将转基因片段直接注射到小鼠的受精卵中，转基因片段将会在小鼠基因组中进行随机插入，因为是完全随机的，有 可能会插入到一些抑制区导致转入的基因不表达，也有可能插入到一些增强区导致转入的基因高表达。通过原核注射的方法得到的第一代转基因小鼠称为 founder（首建鼠），由于上述随机性，每一只founder都是不一样的，以每一只founder起源的品系称为line，不同的line 之间的表达可能会有差异。