实验动物不同于普通动物，它的培育是严格控制在非常清洁的环境中。因此，相对而言，它们的免疫功能是低下或不健全的。人们往往注重它们的饲育、生产环境，忽视使用、实验环境。如，饲育时在无菌隔离器中、层流柜中、或清洁环境中，但实验时，往往放在普通实验室、一般动物室，甚至在走廊、过道和办公室中。从干净环境中突然到普通环境中，会遇到很多病原的侵袭，加之实验动物本身抗病能力不强，非常容易得病、死亡。实验动物得病后，也会对人的健康带来不利影响，特别是一些人兽共患病，如出血热、结核病、狂犬病、菌痢、寄生虫等疾病更是直接威胁我们健康。

经常听到抱怨，说某单位的动物不好，使用时特别容易死亡。恰恰相反，等级越高、越干净的动物，被突然饲养在普通环境内，越容易感染到疾病。

动物实验不可避免要进行病原感染性实验，也是感染性动物模型制备的基础。比如艾滋病动物模型要用到猴，流感病毒要感染小鼠、雪貂；结核模型动物有小鼠、豚鼠和猴等；肝炎模型动物有树枸、转基因小鼠、土拨鼠等。

不同动物对不同疾病病原，包括细菌、病毒和寄生虫敏感性不同，也就是说，有些病原，如艾滋病毒HIV即使注入普通小鼠、大鼠、兔、犬和猴等动物体内，它们也不会得病。目前发现，除了大猩猩能感染HIV（只是一过性感染，不会得病）外，其他所有动物都不会感染人艾滋病HIV，因而也就不会得人类艾滋病。因此，做动物模型制备研究时，一定要多查文献报道，避免反复、重复感染不敏感动物，既伤害动物，也不会有任何结果。

还有使用的动物会不同程度携带有不同微生物（除非使用SPF或无菌动物），感染之前，一定要了解原先是否带有和实验同样或类似的病原。如果有，一定会干扰实验结果，比如已有的免疫状态、抗体产生等会是结果不准确或出现错误。这样也会误用无辜动物，造成伤害。如果携带有人兽共患病病原，易造成人员的生物安全危害，应高度注意。

听说过有人用小鼠做流感病毒感染实验，10天后，同室的其他小鼠也得了流感，实验人员也出现症状。因此，感染病实验的动物一定要隔离进行，不能造成其他动物的感染。

最常见的情况是，实验动物没有良好的设施、设备作保障，动物污染后处理不当，造成环境、动物、人员的生物危害。其实，国家有专门的要求，病原按危害程度被分为1-4类，1-2类称为高致病性病原。所有病原都应该在1-4级不同等级生物安全实验室中进行，以确保安全。