(1)房间的卫生：保持房间清洁卫生，以冲水方式清除动物排泄物时，每天至少需要清理一次，同时应保持动物干燥。在动物进入之前和实验结束后必须进行消毒处理，如在实验过程中发生疫情，也可临时增加消毒次数。

(2)饲育盒、笼架及相关配件的卫生：根据器具大小、动物多寡、垫料使用及种类、动物级别、笼架类比等综合因素，制定合适的卫生处理频率。通常每周至少要清洗一次。

(3)缓冲间、准备室、走廊等附属设施的卫生：保持清洁卫生，每天用消毒液擦拭、拖地，定期用有效浓度的消毒液喷雾消毒。其频率则依该区域的使用情况及污染源特性而定。

(4)水瓶、吸水管、瓶塞、饲料槽及辅助配件的卫生：清洗时务必要使用清洁剂、热水或适宜的化学物质，以达到清洁和消毒之目的。

(5)兔、豚鼠及仓鼠等啮齿类动物的笼具的卫生：因这些动物的尿液中含有较高浓度的蛋白质和矿物质，易与有机物结合而牢固黏附吸附，清洗前应先应用酸性清洗液处理。

(6)害虫控制：在动物饲养环境中，需要建立一套防治、控制及清除害虫的具体实施计划。

在虫害发生和清除时，要注意选择合适的方法，杀虫剂的使用尤其要谨慎。