生命科学实验中的“超级模特”
说起基础研究,最大的功臣之一莫过于动物模型,它们相当于人类的模特,不过人类的模特是试穿衣服,而它们是用于研究各种疾病或是生命现象。酵母,从事生命科学研究的人都不陌生,最近的一篇PNAS文章发现酵母是动物模特中的超级模特,众所周知,酵母没有血管,但是,科学家们却能用酵母来研究血管发生。
也许你很难相信,用酵母可以研究血管发生。是的,这一研究就是由来自德克萨斯大学生物化学系,Howard Hughes医学院的科研人员完成,他们用一种系统的研究方式来完成酵母-人类血管生成研究项目,相关成果文章Systematic discovery of nonobvious human disease models through orthologous phenotypes公布在3月22日的PNAS上。
人、小鼠、酵母、线虫和植物拥有大量的同源基因,尽管表型不同,但来源相同。这些同源基因尽管表型不一,但是却可以用来指导研究人类的疾病。
德州大学系统生物学家Edward Marcotte发现,相同的基因网络系统表现出不同的表型,于是他决定与同事共同寻找影响基因网络系统表型的基因,并且从整个系统生物学的角度来寻找答案。
Edward为此建立了一个数据库,将各种基因表型间的资料以及影响基因表型的关键调控基因的资料归纳入库。他发现,大约300种人类疾病与6000种不同的基因表型有关。这些关联性在各个动物模型中具有相似性,因此,可以通过其他模型中的保守基因来研究人类的疾病。
通过对这些保守基因的分析,科学家们可以将研究结果延伸至人类疾病上,在本研究中,Edward就发现酵母其实是一个研究人类血管发生缺陷疾病的优秀模型,而线虫则是研究乳腺癌的优秀模型,小鼠是研究自闭症的优秀模型,植物是研究神经嵴发育缺陷的优秀模型。
使用这个模型,科学家发现SOXI3是调节血管发生的基因,SECurity23IP是一个Waardenburg gene。所有的这些结果表明,进化保守的基因网络可用于人类疾病的研究,动物模型的适用范围大大扩展,有助于人类早日解开疾病之谜。
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