无菌(germ-free，GF)动物指动物身上不可检出一切生命体的动物。进一步说，是指用现有的检测技术在动物体内外的任何部位均检不出任何微生物和寄生虫的动物。

 无菌动物来源于剖腹产或无菌卵的孵化，饲育于隔离系统。另外，用大量抗生素也可以使普通动物暂时无菌，但这种动物不是无菌动物。因为这种无菌状态往往是一时性的，某些残留的细菌在适当的条件下又会在体内增殖，即使把体内细菌全部杀死，它们给动物造成的影响也是无法消除的。例如，特异性抗体的存在、单核一吞噬细胞系统的活化、某些组织或器官的病理变化等。因此，无菌动物必须是生来就是无菌的动物。