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高通量测序法研究不同pH的饮用水对SPF小鼠肠道微生物的影响
2017年08月09日
来源:中国比较医学杂志 2017年第07期
作者:余强 刘月环 王志远 吴旧生
责任编辑:admin
摘要:本文利用16S rRNA高通量测序技术探讨了不同pH饮用水连续饲养三个月小鼠的肠道微生物稳定性和多样性,为今后动物质量控制打下基础。
目的: 研究不同pH饮用水对SPF小鼠肠道微生物多样性的影响。
方法: 21日龄SPF小鼠90只随机分成3组,每组30只,分别给予三类水,即酸化水(pH 3.0),中性水(pH 7.0)和碱性水(pH 9.0),并进行为期三个月的饲养。每组分别在饲养4周、8周、12周末各处死10只动物,取血清按SPF国标项目检测了细菌、病毒、寄生虫,取回盲部内容物,根据细菌16S rRNA的保守性设计引物,构建文库,进行高通量(Illumina)测序,获得10 G的数据,并对数据进行统计,聚类分析。
结果: 以pH 3.0处理的小鼠肠道微生物丰富度适中,稳定性高。
结论: 在规模化饲养条件下,选取pH 3.0饮用水小鼠能较长时间维持肠道微生物多样性,稳定性达到一个平台。本研究为长期稳定维持动物质量的生产实践提供了理论与技术支持,也是胃肠道宏基因组学技术在动物质量控制领域的一个具体应用。
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