多国加紧研制德国大肠杆菌检测试剂盒
2011年06月09日
来源:中国网
作者:admin
责任编辑:lwc
摘要:针对迅速蔓延的肠出血性大肠杆菌疫情,各国科学家展开研究,希望早日结束这场疫情。虽然致病源还未确定,但不少研究机构和公司都推出了相应的方案,以快速可靠检测出此次“惹祸”的大肠杆菌。
针对迅速蔓延的肠出血性大肠杆菌疫情,各国科学家展开研究,希望早日结束这场疫情。虽然致病源还未确定,但不少研究机构和公司都推出了相应的方案,以快速可靠检测出此次“惹祸”的大肠杆菌。
7日,中国的深圳华大基因研究院公布了第三版的含有最新测序数据的大肠杆菌基因组完成图谱,并表示与其合作研究小组已研制出该大肠杆菌的诊断试剂盒。
根据华大基因的新闻公报,华大基因与军事医学科学院微生物流行病研究所的科研人员日前验证完成了可快速检测该大肠杆菌菌株的聚合酶链反应(PCR)诊断方案。该方法可在收到样品后2到3小时内提供诊断结果,对疫情监控和致病病菌的检测起着重要作用。华大基因对试剂盒的灵敏度和特异性进行数据分析及实验测试,证明了该检测方案具有高度特异性。
美国的生命技术公司一直在和德国明斯特大学医院合作,对疫情进行研究。该公司近日宣布,已经开发出一种试剂盒,可以对导致这次疫情的大肠杆菌进行检测。
美国的生命技术公司负责人表示,定量聚合酶链反应分析是检测有害的食源性致病菌的最准确方法。另外,从速度上看,它也是最快的。传统实验室检测方法需要10天才能获得结果,而这种检测在数小时内就能确定致病菌存在与否。”
据媒体报道,生命技术公司在上周已经向欧洲实验室运送其定制的大肠杆菌检测试剂盒,用于筛选疫情暴发中心被认为污染的食物。
深圳华大基因则表示,会在本周展开更多的验证实验。为了更好地控制此疫情的传播,华大基因与军事医学科学院微生物流行病研究所将免费为全球疾病控制和研究机构提供检测实验方法细节及所需引物序列信息,给全球范围内的病情诊断、疫情监测和污染源调查提供支持。
另据报道,世界卫生组织官员8日说,德国调查人员可用于找出大肠杆菌疫情源头的时间越来越少。
美联社7日援引世卫组织传染病专家盖纳埃尔·罗迪耶的话报道:“如果我们在一周之内找不到‘罪魁祸首’,可能永远都不会知道它是什么。”
他认为,随着时间推移,携带肠出血性大肠杆菌的蔬菜将逐渐从市场消失,从而给德国调查人员制造困难。
揭秘
中国本土精英如何助力破解病菌?
肠出血性大肠杆菌疫情暴发后,德国汉堡-埃彭多夫大学医学院、中国深圳华大基因研究院、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所进行了联合研究,发现了此次疫情的致病菌是包含两种不同菌种基因、毒性很强的新型病菌。本报记者采访了深圳华大基因研究院发言人杨碧澄,了解中国科研人员参与破解致病菌的幕后故事。
北青:中方如何参与到破解工作中的?
华大:疫情发生后,德国汉堡-埃彭多夫大学医学院主动联系了我们,希望对致病菌进行基因组分析。可能因为此前华大和医学院有过接触,对方认可我们在测序及基因组分析方面的能力,所以在第一时间想到了我们。华大马上同意了德方的要求,立刻成立了研究小组,一分钟都没有耽搁。
北青:研究小组有多少人?
华大:深圳华大负责数据分析的核心成员有4个人,基本上都是20多岁,他们中没有“海归”,是我们自己培养的“本土”科研人员,但他们都接触过基因组学的项目,有过很多国际合作项目经验。除此之外,还有很多人员参与到相关实验中,包括北京合作方实验室也提供了一部分支持。
由于时间紧迫,研究人员的工作强度非常大。在得到德国送过来的病菌样本后,几个核心人员好几天没有休息,不分昼夜地收集资料、进行数据分析,用了3天就完成了对病菌的基因组测序。直到现在,他们的工作强度都很大,平均每天要工作十几个小时。
北青:研究中用到了哪些“先进武器”?
华大:这次我们采用的是第三代测序仪“IonTorrent”对病菌进行全基因组测序。这种测序仪是去年在市场上推出的,特点是产生数据速度快。第二代测试仪的数据大概需要一周左右,第三代只需要几个小时。另外,我们还运用了先进的生物信息分析软件,这其中既有华大自己开发的,也有公共平台上提供的免费软件。
北青:德方对中国研究小组的评价如何?
华大:国际上有不同研究小组在对疫情进行研究,中国研究小组的基因组测序是独立完成的,数据是完全公开的。事实证明,我们分析的结果和其他小组是吻合的。我们一直和德方保持密切沟通,所有公布的进展都是对方认可的。
7日,中国的深圳华大基因研究院公布了第三版的含有最新测序数据的大肠杆菌基因组完成图谱,并表示与其合作研究小组已研制出该大肠杆菌的诊断试剂盒。
根据华大基因的新闻公报,华大基因与军事医学科学院微生物流行病研究所的科研人员日前验证完成了可快速检测该大肠杆菌菌株的聚合酶链反应(PCR)诊断方案。该方法可在收到样品后2到3小时内提供诊断结果,对疫情监控和致病病菌的检测起着重要作用。华大基因对试剂盒的灵敏度和特异性进行数据分析及实验测试,证明了该检测方案具有高度特异性。
美国的生命技术公司一直在和德国明斯特大学医院合作,对疫情进行研究。该公司近日宣布,已经开发出一种试剂盒,可以对导致这次疫情的大肠杆菌进行检测。
美国的生命技术公司负责人表示,定量聚合酶链反应分析是检测有害的食源性致病菌的最准确方法。另外,从速度上看,它也是最快的。传统实验室检测方法需要10天才能获得结果,而这种检测在数小时内就能确定致病菌存在与否。”
据媒体报道,生命技术公司在上周已经向欧洲实验室运送其定制的大肠杆菌检测试剂盒,用于筛选疫情暴发中心被认为污染的食物。
深圳华大基因则表示,会在本周展开更多的验证实验。为了更好地控制此疫情的传播,华大基因与军事医学科学院微生物流行病研究所将免费为全球疾病控制和研究机构提供检测实验方法细节及所需引物序列信息,给全球范围内的病情诊断、疫情监测和污染源调查提供支持。
另据报道,世界卫生组织官员8日说,德国调查人员可用于找出大肠杆菌疫情源头的时间越来越少。
美联社7日援引世卫组织传染病专家盖纳埃尔·罗迪耶的话报道:“如果我们在一周之内找不到‘罪魁祸首’,可能永远都不会知道它是什么。”
他认为,随着时间推移,携带肠出血性大肠杆菌的蔬菜将逐渐从市场消失,从而给德国调查人员制造困难。
揭秘
中国本土精英如何助力破解病菌?
肠出血性大肠杆菌疫情暴发后,德国汉堡-埃彭多夫大学医学院、中国深圳华大基因研究院、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所进行了联合研究,发现了此次疫情的致病菌是包含两种不同菌种基因、毒性很强的新型病菌。本报记者采访了深圳华大基因研究院发言人杨碧澄,了解中国科研人员参与破解致病菌的幕后故事。
北青:中方如何参与到破解工作中的?
华大:疫情发生后,德国汉堡-埃彭多夫大学医学院主动联系了我们,希望对致病菌进行基因组分析。可能因为此前华大和医学院有过接触,对方认可我们在测序及基因组分析方面的能力,所以在第一时间想到了我们。华大马上同意了德方的要求,立刻成立了研究小组,一分钟都没有耽搁。
北青:研究小组有多少人?
华大:深圳华大负责数据分析的核心成员有4个人,基本上都是20多岁,他们中没有“海归”,是我们自己培养的“本土”科研人员,但他们都接触过基因组学的项目,有过很多国际合作项目经验。除此之外,还有很多人员参与到相关实验中,包括北京合作方实验室也提供了一部分支持。
由于时间紧迫,研究人员的工作强度非常大。在得到德国送过来的病菌样本后,几个核心人员好几天没有休息,不分昼夜地收集资料、进行数据分析,用了3天就完成了对病菌的基因组测序。直到现在,他们的工作强度都很大,平均每天要工作十几个小时。
北青:研究中用到了哪些“先进武器”?
华大:这次我们采用的是第三代测序仪“IonTorrent”对病菌进行全基因组测序。这种测序仪是去年在市场上推出的,特点是产生数据速度快。第二代测试仪的数据大概需要一周左右,第三代只需要几个小时。另外,我们还运用了先进的生物信息分析软件,这其中既有华大自己开发的,也有公共平台上提供的免费软件。
北青:德方对中国研究小组的评价如何?
华大:国际上有不同研究小组在对疫情进行研究,中国研究小组的基因组测序是独立完成的,数据是完全公开的。事实证明,我们分析的结果和其他小组是吻合的。我们一直和德方保持密切沟通,所有公布的进展都是对方认可的。
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