四川农业大学动物遗传育种研究所九月初在International  Journal  of  Biological  Sciences上发表了题为“Repertoire  of  Porcine  MicroRNAs  in  Adult  Ovary  and  Testis  by  Deep  Sequencing”*的论文，作者利用深度测序技术，深入研究了microRNA在猪成熟卵巢和睾丸中的表达图谱。此项研究由四川农业大学李学伟教授（通讯作者）和李明洲博士（第一作者）领导的课题组与美国休斯顿大学，LC  Sciences公司等机构的科研人员合作完成。

microRNA（miRNA）是一大类短小的内源性RNA，已知它们可以在转录后水平上抑制基因表达，并参与了几乎所有的细胞生理过程。miRNA表达水平的变化与许多疾病密切相关。卵巢卵泡发育与睾丸生精功能是复杂而又协调的生理过程，其中大量基因的严密调节表达和相互作用可能会受到这些miRNA的调控。识别和初步表征生殖腺特异表达的miRNA将是透彻了解由miRNA介导的转录后基因调控在哺乳动物生殖过程中所起作用的先决条件。

研究人员利用深度测序技术（Solexa测序），对成熟卵巢和睾丸内的猪miRNA表达谱进行了鉴定，并利用专门开发的生物信息学分析管道对测序数据进行了深入分析。将可信的成熟miRNA同其它种类的小分子RNA进行了区分。通过这种方法，研究人员共检测到582条前体发夹序列（miRNA前体），编码732条成熟miRNA，其中673条为单一序列。统计学分析显示，224条miRNA（占673条的33.28%）在卵巢和睾丸文库之间存在显著差异表达（P  <  0.001）。大多数位于X染色体（伴X染色体miRNA）的差异表达miRNA（34条中的24条，占70.59%）在卵巢中的表达较睾丸中显著上调（P  <  0.001）。可以预见，伴X染色体miRNA为睾丸优先表达或睾丸特异性表达模式。为了探究伴X染色体miRNA在基因组定位簇之间共表达的可能性，研究人员采用实时荧光定量PCR（q-PCR）技术，考察了在7种常见猪组织中miRNA位点的间隔距离与32个高置信度伴X染色体miRNA共表达模式之间的关系。实验结果显示，邻近的miRNA对常会共同表达，暗示50kb基因组距离内的miRNA通常来源于共同的转录本。