三刺魚已成为研究适应性演化的分子基础的一个强大模型。这篇论文提供了一个高质量的参照基因组序列，同时提供了来自全球海洋和淡水种群的另外20个个体的基因组。基因组分析显示，全球共享的持久性基因变异的再使用，在截然不同的棘鱼（三刺魚是其中一种）种群的重复性演化中、在生殖隔离早期阶段的趋异生态型的维持中都扮演一个重要角色。这些数据说明，在海洋和淡水棘鱼的并行演化过程中，调控性变化扮演一个重要角色。