树鼩IL-2全长编码序列的克隆及分子特征分析
摘要:树鼩作为多种人类疾病模型已受到广泛关注, 而免疫因子对于树鼩模型评价至关重要, 但目前对其白细胞介素-2(IL-2)的研究鲜有报道。该实验以经ConA (concanavalin)诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA 为模板, RT-PCR 克隆出465 bp 的树鼩IL-2全长编码序列, 并采用Clustal W 软件分析其序列和分子特征。结果表明树鼩IL-2 cDNA 编码一个由154 个氨基酸组成的蛋白质, 其cDNA 及氨基酸序列与人的同源性分别为93%及80%, 且其整体结构与人IL-2 相似。MEGA5.0 软件构建的进化树表明, 树鼩与人及恒河猴的亲缘关系较近。Pymol 软件对树鼩和人IL-2 氨基酸序列进行的三维结构模建表明, 两者的IL-2分子三维空间结构基本相似, 表面大部分区域所带电荷相同, 但在某些区域差异较大, 且树鼩多出一个糖基化位点, 这些差异对抗体的结合可能存在影响。该研究为今后树鼩IL-2 单克隆抗体的制备及功能研究奠定了基础。
作者:黄晓燕1, 李明利2, 徐娟1, 高跃东3,4, 王文广1, 殷安国1, 李晓飞1, 孙晓梅1, 夏雪山5, 代解杰1
作者单位:1. 中国医学科学院/北京协和医学院 医学生物学研究所 树鼩种质资源中心,云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,云南 昆明650118;2. 中国科学院昆明动物研究所 中国科学院和云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室,云南 昆明 650223;3. 中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心,云南 昆明 650223;4. 中国科学院昆明动物研究所 遗传资源与进化国家重点实验室,云南 昆明 650223;5. 昆明理工大学 生命科学与技术学院,云南 昆明 650500
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