研究总结模式图。该研究首先开发了 SPH 激活系统并且构建了受 Cre 重组酶调控的 SPH 转基因小鼠，研究者证明了该小鼠可以用于改变肝的代谢分区，星型胶质细胞向神经元的直接转分化以及在脑内实现多基因的同时激活。

1月15日，《自然 - 神经科学》（Nature Neuroscience）发表了题为《利用 CRISPR/dCas9 转基因小鼠在脑内进行多基因的同时激活》的研究论文，该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心、神经科学国家重点实验室杨辉研究组与上海科技大学黄鹏羽实验室合作完成。该研究建立了一种高效的基于 CRISPR/dCas9 的体内激活平台，并且在小鼠脑中实现了包括基因和长链非编码 RNA 在内的多个基因元件的同时激活。该体内激活系统的建立将为在脑内研究复杂的基因网络以及获得性的表型提供重要技术手段。

一直以来，拥有一种能够随意控制基因表达的技术是很多生物学家的梦想。CRISPR/Cas9 系统的出现满足了这种需要，Cas9 就像是一把 DNA 剪刀，在 sgRNA 的带领下，特异性地切割目的序列，并形成 DNA 双链断裂。后来的研究通过失活 Cas9 的核酸内切酶的活性而获得了 dead Cas9（即 dCas9），dCas9 只会在 sgRNA 的引导下特异性的结合到目的位点，而不会产生切割。如果在 dCas9 上融合激活元件，就可以特异性地过表达目的基因。这种方法相对于传统的过表达具有巨大的优势；因为它不受基因大小限制，可以非常方便地同时上调多个基因的表达，而且这种过表达会更加“自然”。虽然 dCas9 介导的基因激活已经被广泛用于体外研究，但利用 dCas9 在体内控制基因表达还一直没有实现。

这项研究中，研究者首先开发了一种较于以往更加强大的激活系统（SPH），并且分别在人和小鼠的细胞里验证了 SPH 系统的高效性。在此基础上，研究者构建了受 Cre 重组酶调控的 SPH 转基因小鼠，并且证明了在 SPH 小鼠的原代细胞里导入 sgRNA 和 Cre 重组酶可以激活基因和长链非编码 RNA。为了确定该转基因小鼠在体内实验中的有效性，研究者通过尾静脉注射了表达 Cre 和 sgRNA 的质粒，发现 SPH 确实可以在肝脏内高效地激活基因的表达。尤其是在激活了 Wnt 通路里的关键基因 Dkk1 后，肝的代谢分区会被改变。为了进一步验证该激活平台是否可以用来研究神经系统的功能，研究者在中脑定点注射了靶向三个转录因子 Ascl1、Neurog2 以及 Neurod1 的 AAV-sgRNA，结果显示星形胶质细胞可以直接被转化为功能性神经元。最后，研究者在 SPH 转基因小鼠脑部定点注射了靶向十个基因或者八个基因加两个长链非编码 RNA 的 AAV-sgRNA 阵列，实现了多个基因在神经元内的同时激活。该研究证明了可以利用 SPH 小鼠在脑内实现复杂基因网络的调节。

该项工作主要由博士后周海波，博士生刘俊来、周昌阳、高妮、饶志平、李贺，在神经所灵长类疾病模型研究组研究员杨辉和上海科技大学黄鹏羽的共同指导下完成，课题组的其他成员积极参与，并得到了神经所研究员张旭、程乐平、徐华泰和神经所基因编辑平台博士施霖宇的大力协助。本工作得到中科院战略性先导科技专项、国家高科技研发项目、中科院重大突破项目、国家自然科学基金会和科学技术部等的资助。