雪貂微卫星DNA遗传多样性分析
2018年09月12日
来源:中国比较医学杂志2018年第8期
作者:刘先菊 滕永康 丛日旭 陈敏 张旭 向志光 滕庆峰 刘云波
责任编辑:admin
摘要:筛选、优化雪貂微卫星DNA引物,评估、分析雪貂种群的遗传多样性。
目的:筛选、优化雪貂微卫星DNA引物,评估、分析雪貂种群的遗传多样性。
方法:采用21个雪貂微卫星位点,对随机抽取的30只雪貂血液样本进行基因组DNA提取及PCR扩增,PCR产物经2%Agrose电泳和6%PAGE电泳鉴定后进行STR扫描检测,用Popgene1.32软件对STR扫描结果进行数据处理和分析。
结果:21个微卫星标记均呈现出遗传多样性,共检测到49个等位基因,观测等位基因数1~4个,平均2.3个;有效等位基因数1.000~3.750个,平均1.6685个;观察杂合度0~0.733 平均0.3216;期望杂合度0~0.642 平均0.3394;香隆指数0~1.177 平均1.0768;多态信息含量0~0.6100,平均0.5485。
结论:本文筛选的21对雪貂微卫星引物,通过微卫星扫描分析验证,具有稳定的PCR扩增,微卫星标记均表现为多态性,并处于期望数值范围,没有显著地偏离Hardy⁃Weinberg平衡期望值。
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