目的：应用高通量测序技术分析树鼩大肠细菌的结构与组成｡

方法：采集3只雄性树鼩大肠内容物,用细菌16SrDNA通用引物扩增V3~V4区,采用IlluminaPE250平台测序｡

结果：共获得160157条有效序列,聚类后得437个运算分类单位(operational taxonomic units,OTUs)｡树鼩大肠中的细菌有9个门､19个纲､37个目､68个科､137个属和194个种｡其中,①厚壁菌门和变形菌门的丰度最高,分别为63.30%和28.52%;②优势纲是芽孢杆菌纲和γ⁃变形菌纲(51.46%､28.02%);③乳杆菌目和肠杆菌

目的：丰度最高,为45.33%和27.51%;④优势科是乳杆菌科(35.30%)和肠杆菌科(27.51%);⑤乳杆菌属和埃希氏菌属为优势属(35.30%､27.49%);⑥在种的水平,可培养细菌的丰度为37.10%,未分类细菌27.69%,不可培养细菌35.21%｡可培养细菌中,唾液链球菌的丰度最高(26.66%)｡在丰度最高的20个种中,8种细菌(40%)未分类,为以往未被发现的新种｡个体间细菌群落存在一定差异｡

结论：树鼩大肠内容物中的细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究｡

全文阅读：树鼩大肠内容物细菌的群落多样性分析