目的：检测高级别肉瘤的树鼩肠道微生物菌群结构,为探讨肠道微生物菌群结构的改变与肿瘤发 生的相关性提供科学依据｡

方法：选取3例患有恶性高级别肉瘤树鼩粪便为CA组,6例健康树鼩粪便为对照NO 组｡ 通过16SV3+4区引物进行细菌多样性的鉴定,通过对Reads剪切过滤,OTUs聚类,并进行物种注释及丰度分 析,得出两组树鼩肠道微生物结构､丰度以及多样性｡

结果：比较CA组和NO组树鼩肠道微生物结构,多样性指 数Chao1指数值､ACE指数值､Shannon指数值差异无统计学意义(P>0.05)｡ NO组的树鼩肠道菌群OTUs为640 种,而CA组为494种,健康树鼩肠道菌群结构呈多样性｡ 在门水平上比较,其中CA组中螺旋体门(Spirochaetes) 丰度为0.03%,低于NO组(丰度为0.12%),且差异有统计学意义(P<0.05);CA组厚壁菌门(Firmicutes)丰度为 77.79%高于NO组(47.65%),但差异无统计学意义;CA组的拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度为0.75%低于NO组 (8.31%),但差异无统计学意义｡ CA组中的乳杆菌属(lactobacillus)是具有统计学意义的生物标识｡

结论：患有 高级别肉瘤树鼩的肠道菌群结构丰度和多样性低于健康树鼩,肠道菌群的结构改变及厚壁菌门含量增加可能增加 恶性肿瘤的发生｡

全文阅读：基于16SrRNA测序对树鼩肠道菌群特征与 高级别肉瘤的相关性分析