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中国地鼠口腔鳞状细胞癌相关的长链非编码RNA差异表达谱建立及应用

2019年12月06日来源：中国比较医学杂志2019年第11期作者：王晓堂肖兰飞高继萍梁宇翔轩瑞晶闫晓如高莉宋国华责任编辑：admin

摘要：筛选中国地鼠口腔鳞状细胞癌组织样本中具有差异表达的长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA),预测其靶基因,探究靶基因的生物学功能及富集的信号通路｡

目的:筛选中国地鼠口腔鳞状细胞癌组织样本中具有差异表达的长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA),预测其靶基因,探究靶基因的生物学功能及富集的信号通路｡

方法:采用二甲基苯并蒽涂抹法建立中国地鼠口腔鳞状细胞癌模型,高通量测序技术构建LncRNA差异表达谱,生物信息学技术筛选差异表达的LncRNA并进行靶基因预测,GO与KEGG富集分析分别预测靶基因的生物学功能及富集的信号通路｡

结果:与正常组织样本相比,口腔鳞状细胞癌组织样本中筛选出54个显著差异表达LncRNA(31个上调,23个下调)｡功能性分析表明:与口腔癌相关的GO条目73条;KEGG富集的信号通路25条｡

结论:中国地鼠口腔鳞状细胞癌样本中差异表达的LncRNA可能通过靶向调控其靶基因参与调控多种生物学功能及口腔癌相关的信号通路,在口腔鳞状细胞癌形成过程中可能发挥重要作用｡

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