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病原学&相关数据分析

钻石公主号游轮上新型冠状病毒(COVID-19)的繁殖数量和可能爆发规模的估计:数据驱动的分析

2020年02月23日 浏览量: 评论(0) 来源:中国实验动物信息网 作者:李晓菲译 责任编辑:admin
摘要:截至2020年2月16日,钻石公主号游轮上已有355例确诊为COVID-19感染。因此,在病毒爆发初期,对新病毒的繁殖数量(R0)进行估计,并对船上每日新发病例进行预测,具有十分重要的意义。
 
摘要:截至2020年2月16日,钻石公主号游轮上已有355例确诊为COVID-19感染。因此,在病毒爆发初期,对新病毒的繁殖数量(R0)进行估计,并对船上每日新发病例进行预测,具有十分重要的意义。
 
方法:我们用伽玛分布拟合报告的序列间隔(均值和标准差),并在R中应用“ earlyR”包来估计COVID-19爆发早期的R0。在假设日感染率服从由日决定的近似泊松分布的基础上,利用R中的“预测”包,将现有日发病率、序列区间分布和估计R0的数据拟合到一个模型中,模拟了可能的累积流行趋势和未来的日发病率。
 
结果:COVID-19在船上早期暴发的R0最大似然(ML)值为2.28。用bootstrap重采样法估计R0值95%置信区间的中位数为2.28(2.06-2.52)。未来10天可能新增病例数将逐步增加,预计未来10天累计病例将达到1514例(1384-1656)。然而,如果R0值降低25%和50%,估计的累计病例总数将分别减少到1081例(981-1177)和758例(697-817)。
 
结论:在钻石公主号游轮的早期,COVID-19的R0的95%置信区间中位数约为2.28(2.06-2.52)。未来的日发病率和可能的暴发规模在很大程度上取决于R0的变化。除非采取严格的感染管理和控制措施,否则我们的发现表明COVID-19有可能在船上引起更大的暴发。
 
关键词:冠状病毒  数学模型  繁殖数量  流行病学
 
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