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通过核酸扩增检测:比较不同样品中2019年新型冠状病毒

2020年02月28日 浏览量: 评论(0) 来源:中国实验动物信息网 作者:李晓菲译 责任编辑:admin
摘要:中国最近出现了与2019年新型冠状病毒相关的严重呼吸道持续性肺炎疫情。本文报告了19例疑似病例的流行病学、临床、实验室及放射学特征。我们使用3种不同的荧光RT-PCR试剂盒比较了不同样品(包括鼻咽拭子,血液,尿液和粪便)中2019-nCoV核酸扩增测试的阳性比率。在19例患者中,有9例使用鼻咽拭子样本检测到2019-nCoV感染,在这9例患者中,有8例使用粪便样本检测到了病毒核酸。 在血液和尿液样本中未发现阳性结果。三种不同试剂盒检测结果一致,2019例nCoV核酸阳性率仅为47.4%。可疑患者中2019-nCoV的核酸检测阳性率仅为47.4%。因此,仅通过核酸检测就可能错过了真正感染的患者。 结合计算机断层扫描和核酸检测进行诊断可能会更好。
摘要:本文报告了19例疑似病例的流行病学、临床、实验室及放射学特征。我们使用3种不同的荧光RT-PCR试剂盒比较了不同样品(包括鼻咽拭子,血液,尿液和粪便)中2019-nCoV核酸扩增测试的阳性比率。在19例患者中,有9例使用鼻咽拭子样本检测到2019-nCoV感染,在这9例患者中,有8例使用粪便样本检测到了病毒核酸。 在血液和尿液样本中未发现阳性结果。三种不同试剂盒检测结果一致,2019例nCoV核酸阳性率仅为47.4%。可疑患者中2019-nCoV的核酸检测阳性率仅为47.4%。因此,仅通过核酸检测就可能错过了真正感染的患者。 结合计算机断层扫描和核酸检测进行诊断可能会更好。
 
关键词:2019年新型冠状病毒性肺炎  临床诊断  核酸扩增试验
 
在严重急性呼吸系统综合症和中东呼吸系统综合症冠状病毒爆发之前,过去20年中大多数人类冠状病毒感染未被认为对人类具有高致病性。尽管冠状病毒在人类和动物中广泛分布,但对正义链RNA病毒的认识有限。
四川省人民医院(10例)和四川省绵阳市404医院(9例)共收治疑似病例19例。我们收集了19例患者的鼻咽拭子、血、尿、粪四种样本进行核酸检测。我们回顾了所有患者的病史、临床图表、护理记录、体检结果和计算机断层扫描(CT),并记录和分析了血液学、生化、放射学和微生物学调查结果。几乎所有的疑似病人都有呼吸道疾病的症状,其中两人有腹泻。取口咽拭子标本,用核酸扩增试验(NAAT)检测病毒性呼吸道病原体。对于所有其他已知的病原体,包括甲型和乙型流感,副流感,呼吸道合胞病毒,鼻病毒,腺病毒和已知会导致人类疾病的四种常见冠状病毒毒株,全部19例均呈阴性。对两例腹泻患者的粪便样本进行检测,排除其他原因的常见腹泻病原体。
 
从样本中提取病毒核酸,并在-80°C下保存。选择轮状病毒中两个高度保守的序列区(ORF1b和N)作为引物和探针。三种不同厂家的2019-nCoV荧光RT-PCR试剂盒用于实时PCR检测,检测效率几乎相同,中位年龄为33岁,女性占57.89%。 根据鼻咽拭子NAAT的结果,根据核酸测试结果,确认9例患者感染了2019-nCoV,其他10例2019-nCoV阴性。我们发现,在CT扫描中,所有9例确诊患者和10例阴性病例中有5例表现出斑块状阴影和毛玻璃样混浊的双边分布。为了避免假阴性结果,我们重新收集了这些阴性病例的口咽拭子样本,并连续三天重新进行2019-nCoV核酸检测。然而,结果仍然是阴性的。
 
因此,我们从所有19个病例的血液,尿液和粪便中提取RNA,以确定NAAT是否可以检测到2019-nCoV。在9名确诊患者中,有8份粪便样本显示2019-nCoV呈阳性结果; 有趣的是,仍然可以在没有腹泻症状的患者的粪便样本中检测到该病毒。但是,其他10例粪便样本中2019-nCoV呈阴性结果,而所有19例样本中血液和尿液样本中2019-nCoV均呈阴性结果。为了避免出现错误的结果,我们使用了三种不同的试剂盒来测试样品,并且每个样品都得到相同的结果。
 
虽然血清中没有检测到核酸阳性,但我们不能说病毒不会进入血液,它可能是在低浓度。在该研究中评估的患者均未被诊断出病毒血症,但是之前有报道说,在感染了其他冠状病毒的病毒血症病人的血清中发现了病毒。鼻咽拭子阳性样本的数量与粪便阳性样本的数量非常接近,在使用鼻咽拭子NAAT确诊的9例患者中,八份粪便样本检测为阳性。这可能表明,即使患者没有腹泻,粪便也可能能够传播感染。在这项研究中,我们比较了不同样品中2019-nCoV NAAT的阳性率,而2019-nCoV核酸检测的阳性率仅为47.4%
因此,仅依靠核酸检测很难精确诊断COVID-19。 结合CT扫描和NAAT结果可能会更好地进行诊断,这对于预防和控制COVID-19可能非常重要。
 
对不起,暂无资料。
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