病原学&相关数据分析
预印本 | 美国首批12名确诊新冠病毒感染者临床特征
2020年3月12日,美国疾病控制预防中心(CDC)Claire M.Midgley领衔,联合加州大学、伊利诺伊州公共卫生部、马萨诸塞州公共卫生部等各级卫生部门及科研机构,共179名作者,在预印本网站medRxiv上发表论文,题为“First 12 patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) in theUnited States”,对美国首批12名确诊新冠病毒感染者临床特征进行了详尽分析。
(注意:预印本网站medRxiv所有论文未经同行评议。)
重要发现提示:
12位新冠病毒感染者病情轻至中度,但发病第二周病情恶化。
3名患者接受瑞德西韦治疗,呼吸症状改善,但出现恶心、呕吐等不良反应。
1名患者在鼻咽拭子转阴后17天、症状缓解超过2周后,痰液中仍检出病毒RNA。
在大多数患者的呼吸道标本中检测出病毒RNA,持续2-3周,最长达29天,这表明诊断新冠病毒感染窗口期很长。
新冠疫情在全球范围持续。新冠病毒RNA检测、病毒培养以及与COVID-19临床病程的关系尚未完全清楚。
为此,研究组描述了美国首批12例确诊新冠病毒感染者的流行病学、临床过程和病毒学特征。
研究组收集了经CDC确诊的12例新冠病毒感染者的人口统计学资料、暴露和临床信息,对患者的呼吸道、粪便、血清和尿液样本进行SARS-CoV-2 rRT-PCR测试、病毒培养和全基因组测序。
流行病学和临床特征
在6个州共有12名患者确诊新冠病毒感染。5名患者门诊治疗后在家隔离,7名患者住院治疗。
12名患者的中位年龄为53岁,男性8例。
从可能接触的最后日期到发病的时间为0-5天。
发病时常见体征和症状是发烧(7例)和咳嗽(8例)。
在整个病程中,共有咳嗽12例,发烧9例,腹泻3例,呕吐2例。
3名未发烧的患者从未住院,仍处于隔离状态。
住院患者的临床过程
中位发烧时间为9天。住院患者在中位发病第9天体温达到峰值。
所有住院患者均出现过室内空气下氧饱和度<94%,最低氧饱和度发生在中位发病第12天。
5名患者报告呼吸困难,4名接受供氧。
2名患者接受了短疗程的皮质类固醇激素治疗。
3名患者在同情用药的原则下接受了抗病毒药物瑞德西韦治疗4至10天。
瑞德西韦可提早终止RNA转录来抑制病毒复制。
使用瑞德西韦治疗后,患者均发生短暂的胃肠道症状,包括恶心、呕吐、胃轻瘫或直肠出血。
未观察到其他瑞德西韦相关症状。
当患者的呼吸症状改善后,停用瑞德西韦。
研究组表示,因为未对瑞德西韦进行随机对照试验,所以无法评估其有效性或安全性。
实验室和影像学检查结果
7例住院患者中有6例患有白细胞减少症,白细胞计数最低点发生在中位发病第9天。
6名患者中有5名降钙素原水平<0.15ng / ml。
所有住院患者的转氨酶水平均升高。
7例住院患者中有3例碱性磷酸酶水平轻度升高>115 U/L。
2名患者乳酸脱氢酶水平升高> 600U/L,与临床恶化相吻合。
3名接受瑞德西韦治疗的患者均发生不同程度的转氨酶升高。
7名患者接受了肺炎影像学检查,最初住院的X线片中,4名患者未发现任何异常,但在发病第二周内均发现单侧或双侧肺部混浊,病情恶化。
病毒学检测
当鼻咽拭子标本检测为阴性时,2名患者的痰液标本仍为阳性,有1名患者在鼻咽拭子转阴后17天、症状缓解超过2周后,痰液中仍检出病毒RNA。
7例粪便中检测出新冠病毒RNA的患者,大多数亦可在呼吸道检测到病毒RNA。
3名腹泻患者均在粪便中检出病毒RNA。
所有患者均未在尿液中检出病毒RNA。
在大多数患者中,患病第一周的PCR循环数(Ct值)低于第二周;在某些患者中,低Ct值持续到患病的第二周和第三周。
上呼吸道Ct值与疾病进展之间没有明显的关系。
在临床迅速恶化的第二周,一位患者第二个星期的血清中呈阳性。
截至2月22日,鼻咽拭子标本最长第26天,痰标本最长第29天,粪便标本中最长第25天仍可检测到新冠病毒RNA。
病毒RNA检测的持续时间因住院状况或供氧需求而异。
治疗结果
截至2月22日,所有患者的症状均缓解,但11名患者仍有咳嗽症状。
中位症状持续时间为14天。
在症状缓解后,在11位患者中有7位患者仍检测到新冠病毒RNA。
截至2月22日,1名患者仍在住院治疗,5名患者仍处于隔离状态。
根据CDC标准,有6例患者中止了家庭隔离。
基因组测序和系统发育分析
从所有12位患者的呼吸道标本中生成完整的基因组序列。
该序列与SARS-CoV-2基因组的85个参考序列有>99%的核苷酸同一性。
系统发育树分析确定了几个不同的亚组,它们彼此之间没有分歧,表明爆发可能仍处于早期阶段。
研究小结
住院患者在发病第二周出现临床或实验室症状恶化,例如低氧血症、发烧增加或转氨酶升高。
尽管一些患者因可能的继发性细菌性肺炎而接受了经验性抗生素治疗,但没有发现细菌共感染的确切证据。
发病第二周恶化与此前报告一致,强调了在发病第一周后进行密切监视的重要性,即使是轻症或无初始影像学异常的患者也是如此。
该研究中病情最严重的患者在发病第二周突然发生临床恶化,这也是唯一在血清中检测到新冠病毒RNA的患者,血清检出病毒RNA与临床恶化有关。
这可能是由于患者体内促炎细胞因子增加、细胞因子失调和内皮功能异常,从而导致临床恶化和血清中检出病毒。
在大多数患者的呼吸道标本中检测出病毒RNA,持续2-3周,截至2月22日,最长达29天,这表明诊断新冠病毒感染窗口期很长。
新冠病毒RNA的水平和RNA检测的持续时间似乎并未随疾病的严重程度而变化,症状缓解后,几例患者的呼吸道标本中检测到了病毒RNA。
论文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.09.20032896v1
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