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作为有身份的小鼠,认识我从名字开始

2020年04月16日 浏览量: 评论(0) 来源:集萃药康 作者: 责任编辑:lascn
摘要:小编我在刚成为一名小鼠铲屎官的时候,养鼠育仔经研究的不少,但着实是被这成千上万品系的一长串名字吓着了,为什么你们个头那么小,名字却可以比我的身份证号还复杂?今天小编就带大家看看,这些名字后面都隐藏着哪些信息吧。

小编我在刚成为一名小鼠铲屎官的时候,养鼠育仔经研究的不少,但着实是被这成千上万品系的一长串名字吓着了,为什么你们个头那么小,名字却可以比我的身份证号还复杂?今天小编就带大家看看,这些名字后面都隐藏着哪些信息吧。

小鼠的名字可以像他们的名片一样,我们可以了解到小鼠的背景品系,来自哪里的实验室或谁培育的,如何培育而来,基因又做了何种修饰等。

小鼠品系分类不同,名称也不一样哦

首先我们要了解到,根据遗传特点的不同,哺乳类实验动物分为近交系、封闭群和杂交群三类,其各自命名方式也有所不同,由于篇幅有限,这里小编重点说一下特殊近交系之遗传修饰小鼠和突变系小鼠的名称都包含哪些信息哦~

小贴士:什么是遗传修饰动物?

遗传修饰动物是指经人工诱发突变或特定类型基因组改造建立的动物。包括转基因动物、基因定位突变动物、诱变突变动物等。以小鼠为例定义有转基因小鼠(transgenic mouse),基因定位突变小鼠(mouse with targeted mutations)和诱导突变(induced mutations)小鼠。


1.转基因小鼠命名

一个转基因品系名称符号由以下五部分组成,均以罗马字体表示。

格式:背景品系-TgX(基因名称)实验室或机构指定序号实验室代码

例如拿BALB/cJGpt-Tg(hCD3E)102/Gpt这个名称来看,我们就可以知道:

背景品系为 BALB/cJGpt

Tg表示转基因(transgene),(格式中X表示插入方式,如TgN表示转基因方式为非同源插入,TgH为同源重组,TgR为逆转录病毒载体感染的插入)

hCD3E表示转入基因名称,写在括号内

102表示实验室或机构指定序号

Gpt表示实验室注册代码


2.基因定位突变小鼠命名

2.1打靶突变品系

由背景品系名、基因名、基因修饰类型、实验室或机构指定序号及实验室代码组成,品系名和基因名称以连字符分开,实验室代码前面加/进行间隔。

格式:背景品系-基因名称基因修饰类型实验室或机构指定序号/实验室代码

如C57BL/6JGpt-Ctnnb1tm1/Gpt

我们能知道C57BL/6JGpt表示背景品系

Ctnnb1表示靶基因名称

tm(targeted mutation)表示该基因修饰品系通过ES打靶方法构建

tm后面的数字1表示实验室或机构指定序号

Gpt表示实验室注册代码


2.2核酸酶介导的突变品系

由背景品系名、基因名、基因修饰类型、实验室或机构指定序号及实验室代码组成,品系名和基因名称以连字符分开,实验室代码前面加/进行间隔。

格式:背景品系-基因名称基因修饰类型实验室或机构指定序号/实验室代码

1)敲除(deletion)或者敲入(insert)

如NOD/ShiLtJGpt-Prkdcem26Cd52/Gpt

我们可以知道背景品系是NOD/ShiLtJGpt

Prkdc表示靶基因

em(endonuclease-mediated mutation)为核酸内切酶介导的突变

em后面的数字代表实验室或机构指定序号

大写C代表cas9方法制作,d代表deletion

d后面的数字44和22代表删除片段的大小

Gpt表示实验室注册代码

2)条件性敲除

如B6/JGpt-Eef1gem1Cflox/Gpt

我们可以了解到品系背景是C57BL/6JGpt

Eef1g是基因名称

em(endonuclease-mediated mutation):核酸内切酶介导的突变

em后面的数字代表founder鼠的号

大写C代表cas9方法制作

flox代表此品系是条件性敲除

Gpt是资源库的注册代码

3.突变系小鼠命名


由背景品系名、基因名、突变名称及实验室代码组成,品系名和基因名称以连字符分开,实验室代码前面加/进行间隔。

格式:背景品系-基因名称突变名称/实验室代码

如BALB/cJGpt-Foxn1nu/Gpt,

我们可以知道BALB/cJGpt表示背景品系,Foxn1表示靶基因,nu则表示突变基因名称,Gpt为实验室代码。


说到这里,大家是不是对这些名称所传达的信息有了一些了解呢?当然,更详细的命名小编就不一一说了,大家有兴趣可以查阅小鼠品系命名相关资料哦~



注:实验室代码(laboratory code):由1-4个字母组成,首字母大写,表示制备或者持有该品系的实验室或者机构。实验室代码由Institute for Laboratory Animal Research(ILAR)来管理,查询可登陆dels.nas.edu/global/ila哦~试试搜索本文中多次出现的实验室代码Gpt吧~

参考资料:

肖杭等主编.实验动物科学与应用[M].南京:江苏科学技术出版社,2008.1

GB 14923—2010.实验动物 哺乳类实验动物的遗传质量控制[S].

对不起,暂无资料。
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