目的    圆环病毒 2 型(porcine circovirus type 2,PCV2)能否感染人类细胞一直都是一个争论的话题。 本研究通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术分析 PCV2 感染人源细胞后的差异表达基因及其相关的信 号通路、生物学功能,以期为人源细胞对 PCV2 及其他病毒产生抗病毒效应的研究提供参考。 

方法    用 PCV2 感染 HeLa 细胞,然后进行 RNA-seq 技术分析,筛选与抗病毒反应相关的差异表达基因( differentially expressed genes, DEGs),并通过实时定量 PCR 进一步验证。 

结果    在感染 PCV2 的 HeLa 细胞中共注释到 15402 个 UniGenes,其中有 387 个 DEGs(包括 267 个上调基因和 120 个下调基因)。 对生物过程类 DEGs 进行 GO 富集和 KEGG 通路分析, 发现富集基因要参与应激反应(97 / 291 DEGs) 和免疫系统过程(80 / 291 DEGs),其中最显著两条途径的基因是 NOD 样受体信号途径(21 / 170 DEGs)和单纯疱疹病毒感染途径(22 / 170 DEGs)相关差异表达基因。 

结论    PCV2 感染 HeLa 细胞之后,改变了细胞的表达谱,获得的 DEGs 及其功能注释信息有助于理解其抗病毒机制,对于了解 PCV2 感染人源细胞所产生的免疫反应及抗病毒效力提供依据。

阅读原文：猪圆环病毒 2 型感染人源细胞的转录组分析.pdf