实验动物的遗传监测，就是为了保证动物的品种、品系的遗传质量与标准一致，并使之在长期的繁殖生产中遗传质量保持稳定不变。

目前，实验动物的品系已达数千个之多，在培育、保种及繁殖生产中，都有严格的要求，但由于影响遗传变异的因素很多，在动物的培育、保种和繁殖、生产过程中，仍然存在着发生遗传变异或遗传污染的可能。对于新引进的动物，或新导入的品系，更需要摸清其遗传概貌。因此，建立遗传质量监测手段，对确保实验动物的遗传质量是必不可少的。

从理论上说，所有由遗传决定的生物学特性都可以用于遗传监测。可是，遗传监测作为一项常规工作需要定期重复进行，所以有必要挑选一些遗传特征，在节约人力和物力的情况下完成实验监测。被挑选的遗传特征应均匀地分布于各条染色体上，能概括整个动物基因组的概况，又要简便易行。

1．形态学方法  通常作为遗传监测用的遗传学遗传标记主要是毛色基因位点测试法。

2．生化技术  目前常用的方法是醋酸纤维薄膜、淀粉凝胶、聚丙烯酰胺胶等为支持物的电泳方法，依据电泳染色谱带上的生化位点表型，确定品系的遗传纯度，并可区分不同的品系。常用近交系小鼠的生化标记基因见表1-1。

常用近交系大鼠的生化标记基因见表1-2。

表1-1  常用近交系小鼠的生化标记基因

表1-2  常用近交系大鼠的生化标记基因

3．免疫学技术  在免疫系统中，起主要作用的T细胞及B细胞膜上有许多糖蛋白，血清中也有补体和免疫球蛋白，都可以作为遗传标记物，用血清学的方法加以应用。应用于近交系动物遗传监测的免疫学技术，一般有血凝试验、细胞毒试验和免疫双扩散技术等。皮肤移植技术是通过同系异体皮肤移植成功与否，来确定它们的组织相容性抗原是否同一，是目前测定近交系遗传质量的重要方法之一。移植的部位有背部、耳部、尾部等。

上述方法主要用于对近交系动物的遗传检测，对封闭群等动物，一般是通过数量性状观察为主的监测，来实现对其遗传质量的监控。数量性状主要包括：种群的基本形态，如体重、毛色、体型等；血生理常数，如白细胞、红细胞、血红蛋白等；生殖生理数据，如性周期、怀孕期、胎产仔数等。也可采用下颌骨测量或辅以生化、免疫等技术，来实现对其遗传质量的监控。