近日，格罗宁根大学，华沙国际分子与细胞生物学研究所和莱顿大学的研究人员详细研究了SARS-CoV-2冠状病毒RNA基因组结构。 RNA结构是开发抗病毒药物的潜在目标。结果于11月10日作为“突破性论文”发表在《Nuclear Acid Research》杂志上。

在整个人类历史中，细菌和病毒引起的传染病一直存在。在过去的18年中，由于冠状病毒（包括SARS和MERS）引起的严重急性呼吸道综合症，导致全世界许多人死亡。最近，持续的COVID-19大流行已经夺走了100万人的生命，表明迫切需要新的方法来对抗冠状病毒感染。

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COVID-19是由SARS-CoV-2（一种带有线性单链正链RNA基因组的β冠状病毒）引起的。与其他RNA病毒相似，SARS-CoV-2 RNA结构有望在冠状病毒在人细胞中的复制中发挥关键作用。尽管具有这种重要性，迄今为止，仅研究了少数功能相关的冠状病毒结构RNA元件。因此，IIMCB（波兰）的研究人员与格罗宁根大学和莱顿大学（均在荷兰）的科学家一起，使用各种先进技术对SARS-CoV-2 RNA基因组结构进行了广泛的表征。

这项研究由格罗宁根大学的Danny Incarnato博士协调进行，涉及RNA结构探测，以获取完整的SARS-CoV-2冠状病毒基因组在体外和在活感染细胞中的单碱基分辨率二级结构图。随后，研究小组确定了SARS-CoV-2 RNA序列中的至少87个区域，这些区域似乎形成了明确的紧凑结构。其中，至少有10％在冠状病毒中处于强大的进化选择压力下。重要的是，这是首次确定整个冠状病毒RNA（具有约30,000个核苷酸的最长的病毒RNA之一）的结构。

Incarnato解释说：“我们首先在体外鉴定了病毒RNA结构，然后确认了它们在细胞内病毒RNA中的存在。这意味着我们的结果非常可靠。”同样，在某些RNA结构中发现了“口袋”状表位，因此可以设计小分子靶向这些口袋，从而阻碍病毒RNA的功能。 此外，由于许多结构在不同的冠状病毒之间是保守的，这意味着靶向SARS-CoV-2的药物也可能有效对抗未来的新病毒株。''

科学家们还发现了SARS-CoV-2 RNA的固有非结构化部分。 Incarnato解释说：“这些可能是反义寡核苷酸治疗的靶标。。

总之，这项合作研究为将来的工作奠定了坚实的基础，该工作旨在开发潜在的小分子药物来治疗SARS-CoV-2感染以及其他冠状病毒的感染。

资讯出处：RNA structures of coronavirus reveal potential drug targets

原始出处：Ilaria Manfredonia et al, Genome-wide mapping of SARS-CoV-2 RNA structures identifies therapeutically-relevant elements, Nucleic Acids Research (2020). DOI: 10.1093/nar/gkaa1053