在动物实验中，为了观察每个实验动物的实验情况，需要对实验动物进行一定的编号标记。常用的标记方法包括染色法、穿耳孔法、剪趾法、挂牌法、挂腿圈法、烙印法、剪尾法、剪毛法。

一、染色法

染色法是指在实验动物身上明显的部位进行染液涂染或利用不同颜色的染液来区别不同分组的动物，这种方法简便，在实验室最常用。常用作编号标记的染液包括：饱和苦味酸溶液涂染成黄色；0.5％中性红或品红溶液涂染成红色；2％硝酸银溶液涂染成棕黄色；甲紫溶液涂染成紫色。

用毛笔或棉签蘸取上述染液，在动物体表不同部位涂抹，以示不同编号标记，其原则为先左后右，从前到后。还可使用2种不同颜色的染液进行标记涂抹，即将某1种染液的颜色作为个位数，另1种染液的颜色作为十位数。涂抹后的动物须待染液晾干后再放回动物笼中，以免未干的颜色蹭到其他动物的身上而影响编号标记。长期实验因褪色须每3周重新涂染1次。

二、穿耳孔法

穿耳孔法是用动物专用耳孔器在动物耳朵的不同部位打一小孔或打成缺口来标记的方法。这种编号方法主要适用于长期实验及体毛颜色较深、不易着色的动物。打孔后常用消毒滑石粉涂抹在打孔局部，防止孔口愈合。

三、剪趾法

剪趾法是将小鼠左右前肢或左右后肢足趾按不同排列方式代表不同的数字而进行标记。剪趾编号方法尤其适用有各种毛色小鼠的实验，避免了黑色、棕色等不同颜色小鼠用染色法标记不易分辨的缺点。剪趾后，应用干棉球止血，再用碘酒消毒即可。

四、挂牌法

挂牌法是指用金属等制作的标牌，写上编号挂在实验动物的颈部、耳部等部位或将分组编号写在卡片上，挂在动物饲养笼外，这种编号方法适用于猫、犬、猪、鸡等大动物的标记。

五、挂腿圈法

挂腿圈法适用于鸡、鸟等禽类的编号，首先将号码冲压在圆形或方形金属牌上，金属牌常用刺激性小、不生锈的铝板或不锈钢制成，也可使用市售的打好号码的铝牌，然后将金属牌固定在拴腿的皮带圈上，将此圈固定在禽类动物腿的根部。

六、烙印法

烙印法是用烙印钳将号码烙压在大、中型动物无体毛部位或明显部位，如耳部、面部、鼻部、四肢等，或采用人工针刺号码，然后用乙醇为溶剂的墨黑染料等进行涂布。

七、剪尾法

剪尾法是将动物尾尖部剪去，一般用于大鼠、小鼠的分组，但仅限于将两组动物区分开，无法给每只动物编号，若需进行尾尖取血，则此法不宜采用。

八、去毛法

去毛法是将动物背部的被毛用剪刀剪去或用脱毛剂脱去，用于标记，此法编号标记清楚、可靠，便于试验人员观察，常用于大、中型动物的编号。

动物实验通常需要根据实验要求对动物进行一定的随机分组，在生物学实验中，由于动物间客观存在的个体差异，只有通过随机分组的方法才可使其对实验结果的影响降低到最小程度。动物随机分组常常使用随机数字表或用计算器产生随机数字来进行。动物随机分组的主要目的是使实验中的主要指标平均分配到各个组中，以确保实验结果的统计学意义，实验分组时还应注意各组动物的数量不可太少，一般需进行统计学处理的实验数据，各组动物至少6只，若再考虑到实验过程中出现意外等情况，动物数量还需适当增加。实验分组时还应考虑到动物性别的影响，如果条件允许，可选择雌、雄各半进行实验，但应保证雌、雄动物的实验数据均应具有统计学意义；若条件不允许，考虑到雌性动物的生理因素，选择雄性动物进行实验为好，但必须使用雌性动物进行的实验除外。