1. 菌体收集
* 从选择培养基中挑取单克隆菌落，接种到含有适当浓度抗生素的2-5毫升LB培养液中，37°C条件下剧烈震荡（300 rpm）培养8小时。
* 将培养后的菌液按照1：500到1：1000的比例稀释至3 ml选择性LB培养基中，37°C条件下剧烈震荡（300 rpm）培养12–16小时。
* 6000 x g离心15分钟后收集菌体细胞，并尽可能去除上清。在0.1-0.5 ml的悬浮缓冲液（50 mm Tris-Cl，10 mm EDTA，100μg/ml RNase A，PH 8.0）中重新悬浮细菌颗粒，直到没有细胞团块。

2. 细胞裂解
* 密封管中加入0.25毫升裂解缓冲液，用力翻转4-6次使其充分混匀，室温（15-25°C）条件下孵育5分钟，不要旋涡，否则会导致基因组DNA断裂。裂解后的菌液应该看起来呈粘稠状，注意裂解反应应控制在5分钟内。
3. 中和反应
* 加入0.3ml中和缓冲液，用力翻转4-6次后置于冰上孵育5分钟。加入中和缓冲液后会形成絮状白色沉淀，使得混合物的粘性降低。沉淀出来的物质中包含基因组DNA、蛋白质、细胞碎片等。溶解液应充分混合，以确保十二烷基硫酸钾沉淀均匀。如果混合物仍然粘稠，则需要进一步的中和，以达到完全中和的效果。当悬浮液为均匀无色状态时，表明SDS已有效沉淀。

4. 过柱
* 将上清液小心地转移至吸附柱并安装至收集管中，13,000 rpm离心1min。
* 若上清液较浑浊，则需进行第二次较短的离心，以避免将悬浮物或颗粒物质保留在吸附柱上。悬浮物（使样品显得浑浊）会堵塞吸附柱，减少或消除流量。

5. 柱平衡
* 向放置于收集管中的吸附柱中添加0.7 ml的洗涤缓冲液，13,000 rpm离心10min。然后使用1 ml平衡缓冲液（750 mM氯化钠，50 mM氯化钾，pH7.0，15%异丙醇）进行平衡。

6. 洗脱
* 用0.8 ml洗脱缓冲液（1.23 mNaCl，50 mM Tris-Cl，ph 8.5，15%v异丙醇）洗脱DNA，在1.5 ml或2 ml离心管中收集洗脱液。
* 通过向洗脱的DNA中添加0.7倍体积（0.56毫升/0.8毫升洗脱体积）的室温异丙醇沉淀DNA，≥10,000 rpm离心30min，去除上清。
* 1ml 70%乙醇洗涤DNA，10,000rpm离心10分钟，去除上清。用70%的乙醇去除沉淀盐，用更易挥发的乙醇代替异丙醇，使DNA更容易再溶解。
* 将吸附有质粒DNA的硅胶膜风干5-10分钟，然后在合适的缓冲液（例如，TE缓冲液，pH8.0或10mm tris-Hcl，pH8.5）中重新溶解DNA。

7. 产量的测定
为了定量核酸浓度，在TE缓冲液中稀释质粒DNA 1:100或1:50（取决于质粒拷贝数），并在260 nm（A260）和280 nm（A280）处测定吸光度（光密度），使用TE缓冲液作为空白对照。此测量方法可使用公式直接计算核酸浓度：
[DNA] (μg/mL) = A260 × Dilution factor × 50
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