(一)对照性原则

在实验中应设立可与实验组比较用于消除各种非处理因素影响的对照组，对照组和实验组有着同等重要的意义，没有对照的实验结果是缺乏说服力的。设立对照的正确方法是把研究对象随机分配到对照组和实验组。

(二)一致性原则

实验中，实验组和对照组的非处理因素应保证一致，这是处理因素具有可比性的基础。非处理因素存在于动物、仪器、试剂、操作人员、环境等各方面，可以通过设计来消除干扰因素或控制干扰因素趋于一致。

(三)重复性原则

同一处理(一组)应设置多个样本例数，使用足够的样本数来观察处理因素的效应能否在同一个体或不同个体中稳定地重复出来。重复的主要作用是估计实验误差，提高实验结果的真实性和可靠性。虽然样本数越大越能够真实反映整体的状况，但实际的研究不允许无限扩大样本含量，运用统计学方法，可以确定获得理想统计效率的最小样本，从而既能够降低实验误差，又有利于控制实验成本。不同组的样本数可以相等或不等，样本数相等时，统计检验效率最高。动物实验中的参考样本数见表3-1-1。

(四)随机性原则

实验分组应按照机遇均等的原则来进行，其目的是降低主观因素和其他偏性因素造成的实验误差。随机分组最好的方法是借助随机数字，可参照随机数字表，或通过电子计算器、计算机产生随机数字，也可采用编号卡片抽签法等。

(五)客观性原则

确定实验观察指标时，应尽量选择客观性指标，少用带有主观成分的指标，定量指标比定性指标更客观，也更精确和灵敏，主观性指标容易受到判断人员经验、意愿和生理因素等的干扰。分析实验结果时，必须采用科学的方法筛选数据、推理结果，而不能以主观意愿随意取舍数据、改动结果。