原来小鼠竟是游泳健将?小鼠表型组数据库告诉你!
大家对于C57BL/6小鼠(俗称B6)可能并不陌生。
但是,作为全球最常用的实验室小鼠近交品系,C57BL/6小鼠其实还有许多不为人知的秘密!
您知道这一品系的雄性小鼠在接受5周的游泳训练后平均可以游591分钟吗?
(图源:电影《精灵鼠小弟》)
您知道C57BL/6雄性和雌性小鼠会比其他品系自行摄入更多的乙醇(即酒精)吗?
如果您未曾了解过,快来查看小鼠表型组数据库吧 (Mouse Phenome Database, MPD)!这里的丰富信息可能对您的研究大有帮助。
小鼠表型组数据库(Mouse Phenome Database,MPD)是由美国国立卫生研究院资助并由杰克森实验室维护的实验小鼠品系特征的网站,是致力于促进人类健康和疾病的转化研究的免费生物信息学资源。
在MPD上,你可以找到多个品系实验小鼠的基因型数据、表型数据、详尽的数据采集方法以及在线数据分析工具。
https://phenome.jax.org
(请复制链接,前往浏览器搜索)
带您认识MPD
MPD涵盖了超过447个JAX不同小鼠品系的数据,其中包括46种最常用的近交系小鼠。
我们为这些品系中的每一种都准备了全面的生理数据总结,汇总了研究人员最常关注的数据。这些数据也为帮助科学家选择最合适的小鼠模型提供了参考。
这些生理数据总结可从各JAX小鼠的品系详情页面“疾病和表型”标签下获取。
常用数据
体重
许多研究人员将体重作为小鼠健康状况和总体状况的基本指标,有时甚至将其作为选择最适合其研究目的的小鼠品系的标准。
血液学概况
了解血液的细胞组成可以帮助研究人员评估动物的健康状况。这些概况包括:
▲ 白细胞 (White Blood Cell, WBC) 计数
▲ 红细胞 (Red Blood Cell, RBC) 计数
▲ 血红蛋白浓度
▲ 血细胞比容
▲ 平均红细胞体积 (Mean Cell Volume, MCV)
▲ 平均细胞血红蛋白浓度 (Mean Cell Hemoglobin Concentration, MCHC)
▲ 血小板计数
▲ 平均血小板体积 (Mean Platelet Volume, MPV)
▲ 网织红细胞计数
▲ 网织红细胞百分比
▲ 网织红细胞血红蛋白含量
▲ 中性粒细胞、淋巴细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞计数
▲ 中性粒细胞、淋巴细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞百分比
血清生化指标
许多科学家使用血清生化指标作为主要的健康指标,并研究常见的疾病状态。血清生化指标数据包括:
▲ 白蛋白和总蛋白水平
▲ 血液尿素氮 (Blood Urea Nitrogen, BUN)
▲ 电解质(钙、磷)
▲ 脂质水平(包括胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇 (High Density Lipoprotein Cholesterol, HDLC)、甘油三酯和游离脂肪酸)
▲ 葡萄糖(饱腹)
▲ 丙氨酸转氨酶 (Alanine Transferase, ALT),
▲ 肌酸激酶 (Creatine Kinase, CK)
▲ 甲状腺素 (T4)
器官重量
▲ 脑
▲ 心脏
▲ 肝脏
▲ 肾脏
▲ 脾脏
▲ 其他
身体构成(DEXA分析)
▲ 骨骼矿物质密度
▲ 骨无机盐含量
▲ 瘦肉组织
▲ 脂肪组织
免疫学特征(通过流式细胞术进行脾脏分析)
▲ 淋巴样细胞百分比(包括B 胞、T细胞、NK细胞和NKT细胞)
▲ 骨髓细胞百分比(粒细胞和单核细胞)
您可以利用这些基线数据选择合适的近交系、优化实验设计、减少不必要的预实验,从而让研究更加高效。
将不同品系进行比较
不仅如此,MPD还提供一些工具来帮助您比较不同品系的数据。例如,如果您要测量特定因素诱导后出现的发热情况,您可能需要使用基线体温较低的品系。而在下图的比较数据中,您可以快速发现C3H/HeJ或BALB/cJ可能是不错的选择。
上传您的数据
MPD另一个有趣的功能是,您可以上传自己的数据并将其与已发表的数据并行比较,还可以将结果导出到工作表中。例如,如果您正在测量特定品系对高脂饮食或特定感染的反应,您可以下载各个相关数据并直接将其与您的数据进行初步比较。
无论您想知道您的小鼠爱吃甜食还是酗酒,在MPD中都可以找到基线数据。
如果您还在苦苦纠结如何选择品系、预实验能不能省去,如何简化实验降低预算这些问题,快来MPD研究一下已有的数据吧!
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