自发性肿瘤再现了肿瘤发生、发展的全过程，许多动物的肿瘤在组织发生、临床过程和组织形态学上都与人类的肿瘤有相似之处，与其他类型的肿瘤动物模型相比，选用自发性肿瘤模型进行肿瘤发病学及机制研究等实验都较为理想，也更利于将动物实验结果推及于人。小鼠的基因95％以上与人类同源，用小鼠自发性肿瘤模型研究人类肿瘤有着比其他动物更大的优势。

动物自发性肿瘤一般恶性度不高，转移情况也较少发生，这些都有别于诱发性和移植性肿瘤动物模型。另外.在发病机制上自发性肿瘤动物模型也和人类肿瘤不尽相同，自发性肿瘤动物模型的自发因素较为简单，而人类肿瘤的发病因素则较为复杂，如小鼠自发性乳腺癌模型主要由病毒引起，而临床上人乳腺癌的发生可能与雌激素水平紊乱等多种因素有关，这也是研究者在分析实验结果时值得注意的。总体而言，可供选择的理想的自发性肿瘤动物模型并不多，而且动物的自发肿瘤大多散在出现在10个月以后，因此实验周期长，均一性较差，实验成本也高，故而在实验研究中的应用并不普遍。