目的 探究T1L和NBV两种呼肠孤病毒对小鼠肠道菌群结构的影响。 

方法 将 25 只小鼠随机分 为 5 组(对照组、NBV 滴鼻组、NBV 灌胃组、T1L 滴鼻组、T1L 灌胃组),每组 5 只。 对照组用 PBS 灌胃,其余组别均 用 2 × 107 PFU/ mL 病毒滴度感染小鼠。 7 d 后采集小鼠粪便,从每组 5 个样本中选出粪便重量较重的 3 个样本,对粪便 DNA 进行 V3+V4 可变区特异性扩增,运用 16S rRNA 测序分析小鼠粪便中菌群的丰度、多样性及物种组成结 构。 

结果 T1L 和 NBV 灌毒后的小鼠肠道菌群丰度和多样性与对照组相比有所下降,且 T1L 滴鼻组下降最为显著 (P< 0. 05);与 NBV 灌胃组相比,NBV 滴鼻组的菌群丰度和多样性增加显著(P< 0. 05)。 在门的级别上,T1L 和 NBV 灌胃组中厚壁菌(Firmicutes)丰度明显减少,T1L 和 NBV 滴鼻组中拟杆菌(Bacteroidetes)丰度明显减少;在属的级别上,T1L 滴鼻组、T1L 灌胃组和 NBV 灌胃组中罗姆布茨菌(Romboutsia)丰度明显减少,T1L 滴鼻组中别样杆菌 (Alistipes)丰度明显增加(P<0. 05)。 

结论 T1L和NBV感染小鼠会降低菌群的丰度和多样性,可能通过有益菌减少或致病菌增多来破坏菌群平衡。此外,病毒的感染方式不同,对菌群的影响也有所不同。 

阅读原文：基于16S rRNA测序分析两种呼肠孤病毒对小鼠肠道菌群的影响.pdf