目的 从肠道菌群途径分析雄性日本大耳白兔黑眼系(white hair and black eyes rabbit,WHBE 兔)和日本大耳白兔胆固醇代谢的差异性。 

方法 各取4 ~ 5月龄雄性WHBE兔和日本大耳白(JW)兔6只,取血检测血脂水平,并取结肠内容物提取DNA后进行16S rRNA微生物测序,观察肠道菌群结构与功能的变化。 

结果 雄性 WHBE 兔血清总胆固醇(TC)和低密度脂蛋白-胆固醇水平(LDL-C)均明显低于JW兔(P< 0. 05)。 多样性分析显示,两品系兔的肠道微生物群分离明显,WHBE兔Chao1指数显著低于JW兔(P<0.05)。 在门水平,WHBE兔梭杆菌门、软壁菌门和蓝藻菌门的丰度低于JW兔(P< 0. 05,P< 0. 01),且厚壁菌门/拟杆菌门比值亦低于JW兔(P> 0. 05)。 在属水平,WHBE兔中有 24 个菌属的相对丰度与JW兔存在显著性差异(P< 0. 05,P< 0. 01)。 LEFSe分析显示,WHBE 兔中发现了 5 个关键菌属,以理研菌科 RC9 群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)最多;JW 兔中发现了10个关键菌属,以瘤胃球菌科 UCG-014(Ruminococcaceae_UCG_014)最多。 PICRUSt功能预测显示,两品系兔肠道菌 群中的花生四烯酸代谢和醚脂代谢途径存在显著差异(P< 0. 05,P< 0. 01)。 相关性分析显示,TC和LDL-C水平与短波单胞菌属(Brevundimonas)、回肠杆菌属( Ileibacterium)、梭杆菌属(Fusobacterium)、罗尔斯顿菌属(Ralstonia)、 Mollicutes _ RF39 _ unclassified呈正相关, 与 Coriobacteriaceae _ unclassified、 厌氧菌属 ( Anaerovorax )、 梭菌属 (Clostridium)、DTU014_unclassified、Barnesiellaceae_unclassified、瘤胃球菌科 UCG-009(Ruminococcaceae_UCG_009)、 Clostridiales_vadinBB60_group_ unclassified呈负相关。 

结论 雄性WHBE兔和JW兔胆固醇代谢的差异性与宿主的肠道菌群结构与功能差异有关,其中肠道菌群中的花生四烯酸代谢和醚脂代谢途径尤为关键。 

阅读原文：基于肠道菌群探讨雄性WHBE兔与日本大耳白兔胆固醇代谢的差异性.pdf