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实验小鼠核酸样品单核苷酸多态性标记检测的能力验证结果评价
2023年02月07日
来源:实验动物与比较医学2022年第6期
作者:魏杰 张心妍 王洪 赵蓝 刘巍 李欢 付瑞 乔涵 赵萌 项新华 岳秉飞
责任编辑:lascn
摘要:通过实施全国范围的小鼠DNA核酸样品单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNP) 标记检测能力验证计划,检测各实验室小鼠遗传质控SNP检测技术水平,推动核酸样品及SNP检测技术的应用。
目的 通过实施全国范围的小鼠DNA核酸样品单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNP) 标记检测能力验证计划,检测各实验室小鼠遗传质控SNP检测技术水平,推动核酸样品及SNP检测技术的应用。
方法 按照中国食品药品检定研究院2022年组织实施的“NIFDC-PT-365实验小鼠DNA样品SNP标记检测能力验 证计划”方案要求,各参加实验室均获得 BALB/c 和 C57BL/6 来源的随机编号 DNA 盲样 2 份、作业指导书、 rs3023177和rs3023382 SNP位点引物2对。参与者在规定时限内提交报告和原始记录,突变位点扩增测序结果与方 案预设一致时判为满意,否则判为不满意。同时,对各实验室的PCR扩增体系及测序比对方式进行比较,分析可能 影响小鼠核酸标准样品SNP检测结果的相关因素。
结果 10个参加实验室在2个SNP位点的盲样测序分型上皆与 预设一致,均获得满意结果。不同扩增体积 (20 µL、25 µL、30 µL)、不同Taq酶体系 (单组分与PCR MIX),以 及不同的测序公司、测序方向、比对软件均未影响结果准确性。
结论 各参加实验室在小鼠DNA核酸样品SNP标 记检测项目上均具有较强的检测能力。SNP检测技术在小鼠遗传质量评价中简便易行,值得推广。
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