基于转录组学探讨阿比朵尔对HCoV-OC43感染诱导神经营养因子信号通路活化的影响

来源:中国比较医学杂志2023年第6期 发布时间:2023年08月16日 浏览次数: 【字体: 收藏 打印文章

目的 采用转录组学技术分析阿比多尔(arbidol,ARB)对 HCoV-OC43 感染引起宿主信号通路活化 的影响,并探讨 ARB 抗炎活性与其作用于神经营养因子信号通路的关系。

方法 用 OC43 感染 HRT-18 细胞,并以 ARB 进行干预。 感染 96 h 后提取总 RNA,进行转录组学分析,获得差异表达基因( differentially expressed genes, DEGs),开展基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,筛选出 ARB 可能作用的生物学过程 及相关信号通路。 进一步利用 RT-qPCR 方法验证 ARB 干预对神经营养因子信号通路关键分子表达的抑制作用。

结果 与病毒感染组相比,高、中和低剂量(6、2 和 0. 67 μg / mL)ARB 干预分别显示出 9459、4186 和 1744 个 DEGs。 GO 分析显示,ARB 主要干预的生物学过程是共翻译蛋白膜靶向,作用的细胞组成为粘着斑和细胞-底物间连接, 影响的分子功能为钙粘蛋白结合。 KEGG 分析发现,与冠状病毒感染相关的细胞凋亡信号通路和神经营养因子信 号通路有明显富集,其中 ARB 对神经营养因子信号通路中的 MAPK、PI3K 和 NF-κB 通路分子有显著抑制作用。 RT-qPCR 检测显示,ARB 对 PIK3CA、AKT、TRAF-6、Bax、p38 和 c-JUN 等分子的 mRNA 表达具有明显抑制作用。

结论 本研究提示了 ARB 应用于治疗冠状病毒感染引起神经炎症的可能性。

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