树鼩是一种分布于南亚、东南亚及我国南部地区的小型哺乳动物。由于其与灵长类动物亲缘关系近，且成体个体小，繁殖周期较短，养殖成本低，树鼩具有作为新型实验动物的美好前景，且一直有提议用于替代生物医学研究中使用的非人灵长类动物。 

 

    前期中科院昆明动物所动物模型与人类疾病机理重点实验室、深圳华大基因研究院合作完成了树鼩基因组草图，注释了相关基因，从基因组水平证实树鼩是灵长类的近亲，阐明了树鼩用于若干疾病模型创建的遗传基础，该研究结果2013年发表在《Nature Communications》期刊后，掀起了树鼩研究的热潮。树鼩基因组的完成为研究人员提供了大量基础数据，更多关于树鼩基因功能、药物靶点、疾病模型等研究正在如火如荼地进行中。然而，由于种种原因，一些研究人员难以高效的利用这些海量的树鼩基因组数据。为了让众多研究者能方便地访问树鼩基因组的数据资源，获取对树鼩基因功能研究有用的信息或线索，来自姚永刚学科组的范宇和余丹丹整合了现有树鼩基因组相关数据，更新了相关基因预测信息，构建了一个信息含量丰富，使用方便，分析工具齐全的树鼩基因组数据库（http://www.treeshrewdb.org/）。 

 

    树鼩基因组数据库设计了3个功能模块组成：检索模块、数据分析模块、数据传送模块。检索模块提供了“一站式”检索功能，使用户可以浏览到树鼩所有注释基因的相关信息，包括基因名、基因位置、基因序列和对应的蛋白质序列、同源基因、基因的功能注释、基因表达谱信息等，而且可以链接到相应的数据库，以便进一步获取信息。数据分析模块整合了一些常用软件，比如Blast，Muscle，GeneWise等，并自主编写了一些序列处理软件，如ExtractSeq，ReverseSeq，TranslateCDS。在数据传送模块，用户可以下载树鼩基因组相关数据、分析结果或将结果传送到个人电子邮箱中。 

 

    目前，树鼩基因组数据库已经对外开放。相信该数据库的发布将为树鼩生物学研究提供一个有利的交流平台。关于该数据库的详细描述，近期发表在《Scientific Reports》期刊。文章链接： http://www.nature.com/srep/2014/141121/srep07145/full/srep07145.html