实验目的不同，实验动物的选择亦不相同。实验动物的种属、品系和个体合适与否，往往是实验研究成败的关键。一般来说用于供研究的实验动物应具备：个体间的均一性、某些遗传性能的稳定性和来源较为充足这三个基本要求。

1、  种属的选择

由于动物的进化层次低于人类，故实验动物的许多生物学特性，如易感性、组织类型、结构机能、生物放大系统以及生态行为与人类均有一定的差异。这些差异的存在，将影响动物实验结果应用于人体机理和疾病研究的合理性。因此，在选用实验动物时，应尽可能选择其结构、功能和代谢特点接近于人类的动物。
不同种属的动物对于同一致病刺激物和病因的反应不同。动物对致敏物质的反应程度的强弱大致为：豚鼠>家兔>狗>小白鼠。故过敏反应或变态反应的研究宜选用豚鼠；家兔体温变化灵敏，常用于发热、热原检定、过热和解热药的实验。

2、品系的选择――遗传学原则

实验动物的生物学特性如：解剖结构、生理生化特性、行为特点、疾病与免疫、药物反应、对病原体的感受性、生殖与寿命等均与其遗传学背景相关。同一种动物的不同品系，对同一致病刺激物的反应并不相同。例如，以嗜酸性粒细胞为变化指标，C57BL小鼠对肾上腺皮质激素的敏感性比DBA小鼠高12倍，再如，津白Ⅱ号小鼠容易致癌而津白Ⅰ号小鼠就不易致癌。因此，欲获得可靠而准确的实验数据，应严格动物品系的选择。

3、个体的选择

即使在同一品系的实验动物中，不同个体对同一致病刺激物的反应亦存在着个体差   异。个体差异的产生原因与年龄、性别、健康情况和生理状态有关。

1）年龄：减少同一批实验动物的年龄差别，可以增加实验结果的准确性和可靠性。年幼动物一般较成年动物对刺激敏感，故要根据实验的目的选用适龄动物。急性实验多选用成年动物，慢性实验最好选用较年幼的动物。动物年龄可按体重大小来估计。

大体上，成年小白鼠为20～30克；大白鼠为180～250克；豚鼠为450～700克；兔为2.2～2.5千克。
2）性别：性别不同对实验的敏感程度可不同。例如，大鼠皮下注射0.1mL~0.2mL的30%乙醇溶液，雄性动物死亡84%，而雌性动物死亡30%。在CPB-N品系小鼠中，给予环己巴比妥时，雄鼠的睡眠时间比雌鼠长，而且这种性别差异只能在成熟期的小鼠中看到。因此，在实验研究中，只有在已证明无性别影响时，才可雌雄不拘。如对性别无特殊需要，在各组中宜选用雌雄各半。

3）生理状态：动物在特殊生理状态如妊娠、授乳期时机体的反应性有很大变化。如在实验过程中出现动物生理状态的改变导致观察指标受到严重影响，应做相应的适当处理。

4）健康情况：动物的健康状况对实验结果的正确与否有直接的影响。故要选择健康状况良好的动物用作实验。从外观上看，健康动物体形丰满，发育正常，被毛紧贴身体且浓密而有光泽，眼睛明亮活泼，行动迅速，反应灵敏，食欲良好。腹部无膨隆，肛门区清洁，外生殖器及爪趾无病理性损伤。动物的微生物检验亦要符合微生物检测的等级要求。

4、选择有利于实验结果解释的动物
一旦决定所选用的动物品种或品系，就要考虑选择有利于解释实验结果的实验动物，使实验结果的准确性、可靠性、重复性好，这样既可达到实验的目的，又利于实验结论的推广和应用。