烙印法是直接把标记编号烙印在实验动物身体上的方法，犹如盖印章一样。烙印方法有两种，对犬等大动物，可将标记号码烙印在其皮肤上(如耳、面、鼻、四肢等部位)，对家兔、豚鼠等动物，可用数字号码钳在其耳朵上刺上号码；烙印完成后，伤口涂抹酒精黑墨等颜料，即可清楚读出号码。烙印法对实验动物会造成轻微损伤，操作时宜轻巧、敏捷，必要时麻醉，以减少痛苦。