在骨髓中，造血干细胞既可通过分化变成任何一种类型的血细胞，也可通过自我更新维持自己的数量。2011年12月4日发表在《自然-遗传学》期刊的论文“《Dnmt3a是造血干细胞分化所必需的》(Dnmt3a  is  essential  for  hematopoietic  stem  cell  differentiation)”表明DNA甲基转移酶(DNA  methyltransferase)Dnmt3a基因丢失或发生突变导致造血干细胞大量存在和血细胞缺乏。

在整个发育过程中，DNA甲基化是一个表观遗传标记，能够稳定地指导基因表达，但是DNA甲基化也不是一成不变的，会根据实际的发育需要，发生动态变化，发生甲基化或者去甲基化。对于造血干细胞而言，在未接受让它们进行分化的信号时，它需要表达一些基因让自己维持在干细胞状态。但是若要进行分化，Dnmt3a必须先对这些基因进行甲基化，让它们失活而不能表达，这样才能进行分化。

2011年12月27日，来自美国波士顿儿童医院血液学/肿瘤学部门和达纳-法伯癌症研究所(Dana-Farber  Cancer  Institute)小儿肿瘤学部门的Jennifer  J.  Trowbridge和Stuart  H.  Orkin在《自然-遗传学》期刊上在线发表一篇新论文，揭示DNA甲基转移酶Dnmt3a沉默造血干细胞中的自我更新基因以便允许造血干细胞进行有效的造血分化。他们发现Dnmt3a可直接诱导一些基因(如Runx1和Gata3)的启动子区域发生甲基化，从而抑制这些基因表达以便造血干细胞进行分化。他们还发现Dnmt3a也可通过甲基化编码转录因子的基因从而抑制它们表达的方式间接抑制自我更新基因(如Nr4a2)表达。再者Dnmt3a还可能通过与其他蛋白或转录调节物发生相互作用的方式间接抑制自我更新基因表达，并且这种方式与Dnmt3a的酶活性没有关系。

由于很多患有急性髓细胞样白血病(acute  myeloid  leukemia)的病人Dnmt3a基因发生突变，以及10%的患有骨髓异常增殖综合症(myelodysplastic  syndrome)的病人在该基因上也发生突变，这些发现有助于未来开发出新的治疗方法。