近交系（inbred strain）:

BALB/c小鼠形成了许多亚系，如BALB/cAnN, BALB/cJ，BALB/cCd。BALB/c小鼠基因型为Aabbcc。毛色为白色。其乳腺癌发病率低，但对致癌因子敏感。乳腺肿瘤发生率约为10﹪~20﹪。有一定数量的卵巢、肾上腺和肺部肿瘤、白血病的发生。肺癌发病率雌性26﹪，雄性29﹪。白血病发病率雌性12﹪，雄性10﹪。血压与其他近交系小鼠相比为最高，有自发高血压症。老年小鼠心脏有某些病变，雌雄小鼠常有动脉硬化。几乎全部20月龄的雄性小鼠均有淀粉样变。对鼠伤寒沙门氏菌C`5敏感，对麻疹病毒中度敏感，易患慢性肺炎，对放射线极度敏感。富于网状内皮细胞的器官（如肝、脾）与体重相比，所占比值很大。常用于单克隆抗体和免疫学研究。 BALB/c小鼠生产性能好，繁殖期长，一般无相互侵袭习性，比较容易群养。平均寿命：有的记载雄鼠为509天，雌鼠为561天；有的记载雄鼠为648天，雌鼠为816天。平均体重252日龄雄鼠为30 g，雌鼠为28g。

C57BL小鼠基因型为aaBBCC。毛色为黑色。C57BL小鼠对Graffi 白血病因子较敏感。对麻疹病毒敏感。乳腺肿瘤发生率低。网状组织肿瘤自发率，雌鼠少于10﹪，雄鼠为4﹪。较老的动物中有垂体腺瘤发生。老年性肾硬化症常见。有些亚系有遗传性的脑积水。C57BL小鼠对化学致癌物诱导作用敏感性低，但全身经放射线照射后，淋巴瘤发生率达90﹪~100﹪。腰椎六个，有许多骨骼方面的变异。亚系C57BL/He和C57BL/An，与其他的C57BL和C58不同，它们有元素Ce的高效肝分解酶。C57BL小鼠适于穴居，非地面生活的小鼠，对逃避侵袭的反应性不敏感。于无特殊病原体（SPF）环境中，在用代乳鼠喂养条件下的平均寿命，雌鼠为580天，雄鼠为645天。

C3H/He小鼠：C3H小鼠是Strong于1920年用Bagg白化雌鼠与DBA雄鼠杂交后经连续全同胞近交而育成。C、CBA、CH1和C121等品系亦出于本杂交组合。1930年自Strong处转到Andervont（An）处。经近交繁殖至35代时，于1941年到Heston（He）处，成为C3H/He。到1975年时，繁殖达135+代。目前 C3H/He小鼠已在各地大量使用，形成了许多亚系，如C3H/HeN，C3H/HeJ等。C3H/He小鼠基因型为AABBcc。毛色为白色。其14月龄小鼠自发肝癌发病率达85﹪。自发乳腺肿瘤发病率：繁殖雌鼠平均达90﹪（318日龄雌鼠为100﹪，234日龄繁殖雌鼠为67﹪），272日龄繁殖雄鼠为84﹪。补体活性高。168日龄平均体重：雌鼠为32 g，雄鼠为34g。

封闭群（closed colony），又称远交群（outbred stock）：

KM小鼠：即昆明小鼠，一直是我国生产量、使用量最大的远交群小鼠，被广泛应用药理学、毒理学等领域的研究，以及药品、生物制品的生产与检定。1926年美国Rockfeller研究所从瑞士引入白化小鼠培育成Swiss小鼠。1944年3月17日卫生部北京生物制品研究所汤飞凡从印度Hoffkine研究所引进Swiss小鼠，饲养在中国昆明中央防疫处。由于该小鼠起初引入地是昆明，故称之为昆明小鼠，这就是昆明小鼠品系名称的由来。KM小鼠基因库大，基因杂合率高，目前国内已从KM小鼠远交群中先后培育出不少近交系 小鼠。KM小鼠被毛白色，54日龄性成熟，雄鼠体重31g，平均日增重0.55g，雌鼠平均日增重0.37g。平均窝仔数7.25只。断乳存活率82.15﹪，胎间隔30.9天。肿瘤自发率较高，占淘汰鼠的22﹪，且从生产第一胎就开始出现。经50多年的选育，现在KM小鼠肿瘤自发率极低。不同地饲养的昆明小鼠封闭群的生长发育与繁殖性能存在一定差异。但其共同特点是抗病力和适应力很强，繁殖率和成活率高。

    ICR小鼠 : Hauschka用Swiss小鼠群以多产为目标，进行选育，以后美国癌症研究所（Institute of Cancer Researcch）分送各国饲养实验，各国称为ICR.

    中国科学院遗传研究所在1973年从日本国立肿瘤研究所引进，1979中国医学科学院分院动物中心（现本所）引进，1978年北京检定所引进，1983年 中国科学院遗传研究所在1973年从日本国立肿瘤研究所引进，1979中国医学科学院分院动物中心（现本所）引进，1978年北京检定所引进，1983年上海计划生育研究所从瑞士苏黎世毒理学研究所引进。品种特征：毛色白化。适应性强，体格健壮，繁殖力强，生长速度快，实验重复性较好，，雌鼠自发性畸胎瘤和管状腺瘤发病率为0%~1%，用氨基甲酸乙酯诱发时，11~16天胚胎期畸胎瘤和管状腺瘤发病率为5.9%，离乳个体管状腺瘤和囊瘤发生率为30%,孕鼠为3%。是国际通用的封闭群小鼠, 我国从美国、日本、英国、瑞士等国引进的ICR，各群体之间在遗传特性方面不可避免地出现了一些差异，在应用时应注意。ICR/JCL小鼠是进行免疫药物筛选，复制病理模型较常用的实验动物。外周血象和骨髓细胞，具有较好的稳定性，是良好的血液学实验用动物。已广泛用于药理、毒理、肿瘤、放射性、食品、生物制品等的科研、生产和教学。

NIH小鼠 ：NIH小鼠是由美国国立卫生研究院（NIH）培育而成。被毛白色。该小鼠的特点是繁殖力强，产仔成活率高，雄性好斗。

CFW小鼠：CFW小鼠最早也是1973年由日本国立肿瘤研究所引入我国的。被毛白色。该小鼠起源于Webster小鼠，1935年英国Carwarth从Rockeffler研究所引进，经过20代近亲兄妹交配后，采用随机交配而成。

LACA小鼠：LACA小鼠最早也是1973年由英国实验动物中心引入我国的。被毛白色。LACA小鼠其实是LACA小鼠引进英国实验动物中心后改名而成的。

NIH小鼠：NIH小鼠是美国国立卫生研究院（NIH）培育而成的。被毛白色。该小鼠的特点是繁殖力强，产仔成活率高，雄性好斗。

突变系（mutant strain）

nude小鼠：即裸小鼠。1962年，英国在非近交系小鼠中偶然发现个别无毛小鼠。两年后，Flanagan证实是不同与一般无毛小鼠的突变种，取名为nude小鼠。该小鼠先天性无胸腺，其T淋巴细胞功能缺陷，是由于一个隐性突变基因所致。该基因位于第11对染色体上，常用“nu”表示裸基因符号。将裸基因“nu”导入其他品系小鼠中可获得不同的突变系。常用的裸小鼠突变系有BALB/c–nu、NC-nu、C3H-nu、Swiss-nu等。裸小鼠纯合子（nu/nu）的主要特征：无毛，裸体和无胸腺。新生裸小鼠已无鼻毛为特征，足尖经常收缩呈螺旋样畸形。成年雌性发情期不规则，卵巢小，用绒毛膜促性腺激素不能诱发排卵，雄性精子为不成盘卷状，新生裸小鼠3周后省长明显迟缓。罗小树纯合子全身几乎无毛，偶见背部有稀疏的带状毛，皮薄有皱褶。皮肤色素BALB\c-nu为浅红色白眼；C3H-nu为灰白色黑眼；C57BL-nu 黑灰色至黑色，运动功能正常。裸小鼠胸腺仅有残迹或异常上皮，这种上皮不能使T细胞正常分化，缺乏成熟T细胞的辅助、抑制和杀伤功能。因而细胞免疫力低下，失去正常T细胞功能。但其B淋巴细胞功能基本正常。成年裸小鼠（6-8周龄）较普通鼠有较高水平的NK细胞活性，而有术（3-4周龄）的NK细胞活性低下，裸小鼠粒细胞比普通小鼠低。罗小鼠的发现为肿瘤学等方面的研究提供了难得的模型材料，目前，该小鼠已成医学研究领域中不可缺少的实验动物之一。

Scid小鼠：即重度联合免疫缺陷小鼠。1983年美国,Bomsa 在近交系C.B-17小鼠中发现该小鼠.Scid小鼠是位于第16对染色体的称之为Scid的单个隐性突变基因所导致。Scid 小鼠外观与普通小鼠差别不大，又毛，被毛白色，体重发育正常。但胸腺、脾、淋巴结的重量不及正常的30%，组织学上表现为淋巴细胞显著缺陷。胸腺多位脂肪组织包围，没有皮质结构，仅残存髓质，主要有类上皮细胞合成纤维细胞构成，边缘偶见灶状淋巴细胞群。脾白髓不明显，红髓正常，脾小体无淋巴细胞聚集，主要有网状细胞构成。淋巴结无明显皮质区，麸皮质区缺失，有网状细胞占据。小肠粘膜下和支气管淋巴集结较少见，结构内无淋巴聚集。特别值得注意的是，少数Scid小鼠，在青年期可出现一定程度的免疫功能恢复，此即为Scid小鼠的渗漏现象。其渗漏现象不遗传，但与小鼠的年龄、品系、饲养环境有关。Scid 小鼠极易斯与感染，在高度洁净的SPF环境下可存活一年以上。两性均可生育，窝产仔数为3-5只。Scid小鼠是继裸鼠出现之后，人类发现的有一种十分有价值的免疫缺陷动物。在肿瘤学免疫学等研究中，Scid小鼠的使用已越来越广泛。