目的：分析阿尔茨海默病(AD)模型小鼠前额叶皮层的差异表达基因,从转录组水平揭示AD的发病机制｡

方法：本研究随机选取9月龄雌性APP swe/PS1ΔE9(PAP)的模型小鼠和野生型C57BL/6J小鼠各5只,提取前额叶皮层组织RNA,用Illumina HiSeq 3000测序｡采用edgeR软件进行表达差异显著性分析｡分析AD组和对照组基因表达变化,并采用qRT⁃PCR对其中6个关键差异表达基因进行验证｡然后对差异表达基因进行聚类分析､GO功能富集分析､KEGG通路富集分析｡

结果：在AD组与对照组之间发现224个差异表达基因(P<0.05,|logFC|>1.0),其中205个基因上调,19个基因下调｡6个关键基因qRT⁃PCR验证结果与RNA⁃Seq趋势一致｡GO功能富集分析结果表明,这些差异表达基因与免疫反应､炎症反应､趋化因子活动以及IgG结合等有关;KEGG通路富集分析结果表明,这些基因参与吞噬､溶酶体､Toll样受体信号通路､细胞因子受体相互作用､NF⁃κB信号通路等重要生物学通路｡

结论：得到AD相关差异表达基因,为利用模型小鼠进行AD相关机制和治疗研究提供了实验依据｡

全文阅读：RNA⁃Seq技术筛选APP/PS1阿尔茨海默病模型小鼠差异表达基因及功能分析