目的：观察不同年龄恒河猴肠道菌群结构和丰度的变化｡

方法：50只恒河猴,分为成年(5~10 岁)､老年(10岁以上)2组,其中成年组33只,老年组17只｡ 采集动物的新鲜直肠粪便,提取DNA后使用Illumina 高通量测序平台对样本中细菌16SrDNA-V3区进行测序,定量分析肠道菌群的结构和丰度｡

结果：老年组和成年 组获得的优化序列数差异无显著性(P> 0.05)｡ α-多样性分析,老年组恒河猴肠道菌群的 Chao1 指数(P= 0.0174)､Simpson指数(P=0.0258)､ACE指数(P=0.0121)与成年组比较降低,Shannon指数与成年组比较升高(P =0.0132)｡ 老年组与成年组相比,在门水平,拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度升高(P=0.0013),厚壁菌门 (Firmicutes)､螺旋体门(Spirochaetes)､疣微菌门(Verrucomicrobia)､粘胶球形菌门(Lentisphaerae)相对丰度降低(P =0.028 P =0.000 P =0.048 P =0.0242)｡ 在 科 水 平,Prevotellaceae 相 对 丰 度 升 高(P =0.0001), Ruminococcaceae､Clostridiales､Spirochaetaceae､Christensenellaceae相对丰度降低(P=0.0039,P=0.0080,P=0.000  P=0.0021)｡ 在属水平,老年组 unidentified_Prevotellaceae 相对丰度升高(P=0.0001),乳杆菌属(Lactobacillus)､八 迭球菌(Sarcina)､unidentified_Spirochaetaceae 相对丰度降低(P=0.0114,P=0.0227,P=0.0028)｡ β-多样性分析,老 年组肠道菌群与成年组分布在不同区域,差异有显著性(P=0.003)｡ LEfSe 分析,在成年组,链球菌属 (Streptococcus)､布赫纳氏菌属(buchnera)､乳杆菌属(lactobacillus)是具有统计学意义的生物标记物｡

结论：恒河猴 肠道菌群的结构随年龄增长而改变｡ 丰度降低,多样性增高｡ 

全文阅读：基于高通量测序的不同年龄恒河猴肠道菌群 结构差异分析