全球各地的科学家都在紧锣密鼓地寻找SARS-CoV-2的抑制剂。SARS-CoV-2是造成COVID-19大流行的新型冠状病毒。现在，研究人员在ACS Nano上报道，他们已经使用计算机建模来评估四种多肽，这四种多肽模拟了人类蛋白的病毒结合域--允许SARS-CoV-2进入细胞的关键蛋白。

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为了感染细胞，SARS-CoV-2利用其突刺蛋白与ACE2受体结合，后者是一种位于某些人类细胞表面的蛋白。这种附着使病毒与宿主细胞膜融合并进入。许多研究人员一直在试图寻找能够阻断这种突刺蛋白关键区域的化合物，从而防止病毒感染细胞。Yanxiao Han和Petr Kral想要利用计算机建模来设计模仿这种突刺蛋白的天然目标ACE2的化合物。

为此，研究人员检查了最近发表的SARS-CoV-2受体结合域与ACE2结合时的x射线晶体结构。他们从ACE2中识别出15个氨基酸，它们直接与病毒蛋白相互作用。然后，研究人员设计了四种含有大部分或全部氨基酸的抑制剂，并添加了他们认为可以稳定结构的额外序列。通过计算机模拟，研究小组研究了抑制剂如何与体内的蛋白结合以及结合所需的能量。其中一种化合物与病毒蛋白的结合特别好。该研究小组表示，这种肽仍需要在实验室和病人身上进行测试，但能够在电脑上缩小候选药物的范围，可能有助于加速这一过程。

参考资料：

Designing peptide inhibitors for possible COVID-19 treatments

Yanxiao Han et al. Computational Design of ACE2-Based Peptide Inhibitors of SARS-CoV-2， ACS Nano (2020). DOI： 10.1021/acsnano.0c02857