目的 多项证据表明帕金森病患者肠道菌群失调,而 Prnp-SNCA-A53T 帕金森病转基因小鼠是否也存在肠道菌群失调尚未见报道,本研究拟对该模型小鼠的肠道微生物生态特征进行分析。
方法 采用 illumina 高通量测序技术对 7 只雌性转基因小鼠及 13 只同性别同周龄野生型小鼠粪便微生物 16S rRNA 基因 V3-V4 区进行测序及生物信息分析,并用 PICRUST 预测差异功能通路。
结果 与野生型组相比,A53T 组小鼠肠道微生物 α 多样性有增高趋势,而且微生物组成及物种也具有显著性差异:A53T 组小鼠肠道微生物在门水平,放线菌门增高(P = 0. 0094),拟杆菌门降低(P= 0. 0498);在纲水平,红蝽菌纲增高(P< 0. 0001),拟杆菌纲降低(P = 0. 0398);在目水平,红蝽杆菌目增高(P < 0. 0001),拟杆菌目(P= 0. 0398)及红细菌目降低(P = 0. 0185);在科水平,红蝽杆菌科增 高(P < 0. 0001),拟杆菌科(P = 0. 0277) 及红杆菌科降低(P = 0. 0185);在属水平,伊格尔兹氏菌属增高(P = 0. 0002),拟杆菌属(P= 0. 0277)及红杆菌属降低(P= 0. 0249)。 另外 A53T 组与野生型组在 9 个功能通路上存在显 著差异,分别是 G 蛋白偶联受体、类固醇激素的合成、青霉素和头孢菌素的生物合成、泛醌和其他萜类醌的生物合 成、甲苯降解的生物合成与代谢、聚糖的生物合成与代谢、电子转移载体、减数分裂以及非洲锥虫病。
结论 本研究结果表明转基因小鼠存在肠道菌群失调,同时转基因模型小鼠与野生型小鼠代谢通路存在差异,为后期研究肠 道菌群菌与帕金森病的关联性提供了理论基础。
阅读原文:Prnp-SNCA-A53T帕金森病转基因小鼠肠道菌群差异.pdf