免疫系统完整的成熟小鼠不能感染EBOV，推测可能是由于其强大的先天免疫系统，尤其是IFN-Ⅰ型反应所导致。腹腔或脑内接种病毒可对乳鼠产生致死效应，推测是由于IFN-Ⅰ型免疫反应系统发育不全所导致。成熟的免疫系统缺陷小鼠，如缺失功能性B细胞及T细胞的SCID小鼠也可被EBOV感染并致死。然而，不同于人类及其他动物模型，SCID小鼠被ZEBOV攻毒后可继续健康存活数周，然后再逐渐出现体重下降及活动减少等症状，20d后死亡。缺失IFN-Ⅰ型免疫系统的小鼠，如IFNα/β受体或STAT基因敲除小鼠，也无一例外的于皮下攻毒后一周内死亡(表14-2和表14-3)。

另一途径是通过将ZEBOV在免疫系统完整的小鼠体内连续传代，来获得小鼠适应株(表14-2和表14-3)。感染这种小鼠适应型EBOV的小鼠于攻毒后3d发病，5d后死亡，死亡小鼠的肝及脾内均可检测到效价高达10的9次方pfu/g的病毒。同时，肝和脾发生的病理改变，以及血清中的转氨酶(天冬氨酸转氨酶，AST；丙氨酸转氨酶，ALT)水平，与被ZEBOV攻毒的灵长类动物模型的病理表征极为类似。然而，与灵长类相反的是，小鼠组织中仅有少量的纤维蛋白沉淀，并且仅腹腔攻毒可致死小鼠，当使用其他攻毒途径时，即使加大攻毒剂量，小鼠仍能存活。