图:图中显示了鉴别出克雷伯氏菌种类的来源。虽然在环境中发现了细菌，但没有证据表明细菌会转移到人类。     

图片来源:巴斯大学

一个国际科学家小组调查了一种可与MRSA媲美的致命耐药细菌的传播，他们发现，尽管这种细菌在牲畜、宠物和更广泛的环境中都有发现，但它们很少通过这种途径传播给人类。

研究人员由来自美国麻省理工学院的Ed Feil教授领导，他们调查了克雷伯氏菌,这是一种生活在肠道内无害的细菌，但如果扩散到身体的其他部位，则会造成危险。

肺炎克雷伯菌是这一科中最著名的一种，可引起肺炎、脑膜炎、尿路感染和血流感染。

这些细菌现在对抗生素具有高度耐药性，有些菌株甚至对碳青霉烯类抗生素具有耐药性，碳青霉烯类抗生素是所谓的“最后手段”类抗生素之一，只有在其他抗生素治疗无效时才会使用。

克雷伯氏菌在英国已超过MRSA成为健康问题，且发病率稳步上升。世卫组织已将该细菌确认为一种关键的优先保健相关病原体。

除了在医院中发现，这种微生物之前也在环境中被检测到，包括牲畜和废水，但直到现在还不清楚这种细菌是否在临床和非临床环境之间传播。

在迄今进行的最大规模的研究中，该团队在15个月的时间里从意大利帕维亚市及其周边的不同地点收集了6548个样本，这种病原体在帕维亚市的医院是一个主要问题，并使用全基因组测序技术对它们进行分析，以检测和识别任何病原体克雷伯氏菌细菌存在。

研究小组用棉球擦拭了医院的病人和社区中的健康“携带者”，从农场、水坑、家畜甚至家蝇和其他昆虫中提取了样本，以检测细菌存在的地方。

从中，他们发现了3482个分离株，包括15个不同种类的克雷伯氏菌阳性样本中有一半含有。

当研究小组对细菌进行基因测序，以找出存在的菌株时，他们发现，在医院中发现的细菌与在环境中发现的细菌之间几乎没有重叠。

领导这项研究的艾德·菲尔教授说:“克雷伯氏菌感染对抗生素的抗药性越来越强，所以过去你可以很容易地治疗大多数尿路感染，现在更常见的是，患者感染不断复发，造成问题。

”克雷伯氏菌还会导致肺炎，约有一半的患者会因此死亡。这些细菌在英国是比MRSA更大的问题。

“我们的研究人员想知道耐药细菌现在是否正在传播到宠物、农场、牲畜、植物和水中，所以我们想调查哪里克雷伯氏菌发现并监测其传播方式，以便告知如何最好地预防和控制疫情。

“我们发现它无处不在，但惊讶的是，在医院发现的菌株与在环境中发现的菌株不同，这表明在两种栖息地之间很少有传播:人类几乎总是从其他人那里感染这种病毒。”

“这证实了控制这些细菌感染的最佳方法仍然是严格的医院卫生，至少在意大利这样资源丰富的国家，与动物或环境接触引发疫情的几率比之前担心的要低。”

这篇论文的第一作者、挪威奥斯陆大学的Harry Thorpe博士说:“我们担心农民可能会从他们的牲畜或土壤中感染这些细菌，我们可能会被污染的沙拉感染，或者如果我们在受感染的湖泊中游泳会生病。”

“我们的研究没有对此提供任何证据，然而，我们确实在猫和狗等宠物身上发现了耐药克雷伯氏菌。兽医和主人应该意识到这一点，因为这些动物可能会造成传播细菌的风险。”

这个名为SpARK的项目财团由巴斯大学领导，但也包括来自英国(威康桑格研究所、布里斯托尔大学和格拉斯哥大学)、挪威、法国、芬兰和意大利的研究人员。这项工作由抗微生物药物耐药性联合规划行动(JPI-AMR)和MRC资助，发表于微生物学性质。   

Feil教授说:“这是在单一地理位置同时进行的最大规模、最系统的研究。

“我们研究了菌株的传播，然而，当它们交换和获得被称为质粒的圆形DNA片段时，抗生素耐药性可以很容易地传递给其他菌株。

“接下来，我们想用一种叫做长读测序的技术来追踪质粒在菌株之间的转移。”

文章标题

A large-scale genomic snapshot of Klebsiella spp. isolates in Northern Italy reveals limited transmission between clinical and non-clinical settings