豚鼠和新西兰兔常用作抗鼠疫药物和疫苗的鼠疫模型动物。实验选用雌性6～8周的豚鼠，1.5～2.0kg的新西兰兔，一般采用鼠疫菌 EV76 1000000 cfu皮下注射攻毒，观察攻毒后观察感染动物的存活率，测定组织脏器做细菌载量，对血液进行免疫抗体如IgG的检测等。具体动物操作实验方法同小鼠和猴子模型部分。

Zhizhen Qi等通过实验证明小鼠、豚鼠和新西兰兔作为疫苗评价模型，其血清IgG的水平依次是小鼠＞豚鼠＞新西兰兔，而豚鼠中抗鼠疫菌F1抗原的抗体水平变异度较小鼠和新西兰兔大，因此在作为疫苗评价模型时，新西兰兔优于豚鼠。另外，新西兰兔也常用作抗鼠疫菌药物的药敏试验和毒性实验的理想模型。