南京农大粟硕教授等大数据分析冠状病毒进化与重组

内容

2016年3月21日，国际学术权威刊物《Cell》旗下子刊《Trends in Microbiology》在线发表了题为“Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses”的论文。该文章第一作者和通讯作者为南京农业大学动物医学院长江学者周继勇团队的粟硕教授，共同通讯作者为中国科学院青年传染病专家毕玉海副研究员和中国科学院高福院士。

冠状病毒(CoV)感染主要引起呼吸系统(鸡传染性支气管炎病毒、犬冠状病毒)和消化系统疾病(猪传染性胃肠炎病毒、牛腹泻病毒、犬冠状病毒、猫冠状病毒等)。人的冠状病毒感染同样以呼吸系统疾病和消化道疾病为主要特征，但疾病发生程度有很大差异。到目前为止，主要感染人的冠状病毒有6种：229E、OC43、NL63、 HKU1、非典型肺炎病毒SARS-CoV和中东呼吸热综合征病毒(MERS-CoV)。

其中SRAS-CoV在2003年引起了8273人感染，包括775人死于该疾病。MERS-CoV是2014年又一次爆发，截止到2015年12月31日，该病毒引起1621人感染，584人死亡，成为对人威胁和危害性极大的疾病之一。尽管MERS病毒目前仍然是有限的人传人的能力，但是仍需要监控其重组和进化，以防止其一旦适应人类后造成的潜在的大流行。

针对目前MERS等冠状病毒复杂的流行情况和快速的重组等特点，这篇文章利用先进的生物信息学分析方法从流行病学调查、发病机理、进化和重组情况等方面对不同的冠状病毒进行了比较分析，并且用大数据网络监测和分析病毒序列预测了存在潜在威胁的动物源性重组冠状病毒，文章最后针对MERS,SARS等冠状病毒的频繁重组提出了具体防控建议。该论文也是南京农业大学青年传染病专家粟硕教授继柳叶刀杂志回溯流行病学分析MERS病例输入中国之后，再一次在高水平权威期刊发表关于MERS等新发传染病流行病学的论文。