平行反应监测PRM服务
平行反应监测(PRM)是一种基于高分辨率和高精度质谱的离子监测技术。PRM技术的原理与SRM/MRM的原理类似,但在分析方法的开发中,PRM更常用于对蛋白质和多肽进行绝对定量。PRM技术能实现复杂样品中的attomole级别的多种蛋白质的检测。
PRM是以Q-Orbitrap为基础的四极杆高分辨率质谱检测平台。与SRM每次执行一次跃迁不同,PRM通过前体离子对每次跃迁执行全扫描,也就是说,同时监控前体离子的所有碎片:首先,PRM采用四极(Q1)选择前驱体离子,选择范围一般为m/z≤2;然后,前体离子在碰撞细胞中破碎(Q2);最后,Orbitrap取代Q3,高分辨率和高精度的扫描所有破碎的离子。因此,PRM技术不仅具有SRM/MRM目标的定量分析能力,而且还具有定性能力。
PRM的优势
1. 质量精度可达到ppm级别,比SRM / MRM更好的消除了背景干扰和假阳性问题,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;
2. 对产物离子进行全扫描,无需选择离子对,更易于分析方法的建立;
3. 较宽的线性范围:增加到5-6个数量级。
SRM/MRM技术的优势
• 高灵敏度;
• 高产量;
• 分析方法更易于开发。
百泰派克生物科技平行反应监测PRM分析主要流程:
1. PRM分析法开发:首先,从质谱库中生成或Skyline软件中选择2种或3种靶向肽。所选的肽对于目标蛋白质应该是唯一的,易于通过LC-MS进行的检测,不能有缺失的切割位点和多次修饰的氨基酸。其次,根据x轴-浓度比,y轴-峰面积比,建立一条标准曲线。
2. 质谱分析:水解后的样品,使用Thermo公司最新的Obitrap Fusion Lumos质谱仪对样品进行质谱分析。
3. 数据分析:使用Skyline软件进行数据分析。
PRM的应用
• iTRAQ中差异蛋白的验证;
• Label Free无标记差异蛋白的验证;
• 多肽和蛋白质绝对定量;
• 量化疾病指标,建立诊断模型;
• 磷酸化蛋白定量,甲基化蛋白定量;
• 其他翻译后修饰蛋白质定量;
• 代谢通路定量分析。
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