在基因功能的研究中，基因是否有效转染靶细胞，是功能研究的前提条件之一。瞬时转染用时少，但得到蛋白量相对少，不能满足蛋白的大量生产，而且外源基因不能在宿主细胞中长期稳定表达。而稳定表达细胞株则弥补了瞬时转染一些功能实验中由于外源基因表达时间短的缺陷，便于长期观察基因对于细胞功能的影响以及蛋白间相互作用。 1. 稳转细胞系 稳定转染就是外源DNA整合到宿主细胞染色体上，使宿主细胞可长期表达目的基因及蛋白。需要在瞬时转染基础上对靶细胞进行筛选，根据不同基因载体中所含有的抗性标志选用相应的药物进行细胞传代，从而得到可稳定表达目的基因的细胞系。最常用的真核表达基因载体的标志物有潮霉素（hygromycin）、新霉素（neomycin）和嘌呤霉素（puromycin）。 2.质粒转染筛选稳定细胞系操作流程 （1）获取外源目的基因信息，选择合适的表达载体； （2）重组表达载体的构建； （3）重组表达载体转染宿主细胞； （4）使用药物进行稳定感染细胞株的筛选； （5）稳转细胞株的鉴定。 3.质粒转染细胞的特点 较病毒载体而言，质粒转染效率相对较低，而且每次整合几率极低，所以稳定细胞株的构建非常耗时耗力，且得率很低，往往需要挑取单克隆株。